Protein–RNA interactions for Protein: P25205

MCM3, DNA replication licensing factor MCM3, humanhuman

Predictions only

Length 808 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM3P25205 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCM3P25205 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCM3P25205 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MCM3P25205 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MCM3P25205 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MCM3P25205 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCM3P25205 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCM3P25205 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCM3P25205 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCM3P25205 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCM3P25205 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCM3P25205 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCM3P25205 TMEM26-202ENST00000399298 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCM3P25205 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCM3P25205 EGR2-201ENST00000242480 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCM3P25205 MMP14-201ENST00000311852 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCM3P25205 FNTB-201ENST00000246166 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCM3P25205 SMARCA4-204ENST00000444061 4938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCM3P25205 PJA1-203ENST00000374583 2692 ntAPPRIS P4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCM3P25205 LIPE-201ENST00000244289 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCM3P25205 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCM3P25205 MARK2P9-201ENST00000430958 1727 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MCM3P25205 SERPINI1-201ENST00000295777 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCM3P25205 DSE-201ENST00000331677 7237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCM3P25205 TYK2-205ENST00000525621 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MCM3P25205 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MCM3P25205 DLGAP4-202ENST00000340491 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MCM3P25205 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MCM3P25205 ARMCX2-201ENST00000328766 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MCM3P25205 KIRREL3-205ENST00000529097 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MCM3P25205 DISC1-206ENST00000366637 6848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MCM3P25205 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MCM3P25205 TRAF3-208ENST00000560371 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MCM3P25205 TBKBP1-201ENST00000361722 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MCM3P25205 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MCM3P25205 NLRP13-201ENST00000342929 3132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MCM3P25205 GSE1-203ENST00000405402 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MCM3P25205 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MCM3P25205 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MCM3P25205 ZNF335-201ENST00000322927 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MCM3P25205 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MCM3P25205 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MCM3P25205 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MCM3P25205 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MCM3P25205 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MCM3P25205 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MCM3P25205 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MCM3P25205 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MCM3P25205 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MCM3P25205 AC016730.1-201ENST00000420828 832 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MCM3P25205 NINL-203ENST00000422516 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MCM3P25205 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MCM3P25205 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MCM3P25205 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MCM3P25205 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
MCM3P25205 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MCM3P25205 ING4-201ENST00000341550 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MCM3P25205 BHLHE40-AS1-204ENST00000620618 2355 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MCM3P25205 STAT4-202ENST00000392320 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MCM3P25205 PCGF2-202ENST00000611883 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MCM3P25205 TRPA1-201ENST00000262209 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MCM3P25205 INTS5-201ENST00000330574 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MCM3P25205 KLHL13-204ENST00000371882 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MCM3P25205 ZC3H18-201ENST00000301011 3729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MCM3P25205 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MCM3P25205 KIAA1614-201ENST00000367587 3309 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MCM3P25205 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MCM3P25205 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MCM3P25205 ACTR2-202ENST00000377982 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MCM3P25205 MYO7A-202ENST00000409709 7462 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MCM3P25205 GOLGA7B-203ENST00000596005 6378 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MCM3P25205 PGAP2-203ENST00000396986 1837 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MCM3P25205 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MCM3P25205 BEGAIN-212ENST00000637716 3259 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MCM3P25205 STK25-235ENST00000543554 2556 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MCM3P25205 SLC2A14-213ENST00000539924 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MCM3P25205 AL118506.1-201ENST00000601296 3082 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
MCM3P25205 MPRIP-202ENST00000341712 3846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MCM3P25205 R3HDM2-204ENST00000402412 4372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MCM3P25205 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MCM3P25205 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MCM3P25205 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MCM3P25205 STAG3-206ENST00000426455 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MCM3P25205 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MCM3P25205 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MCM3P25205 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MCM3P25205 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MCM3P25205 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MCM3P25205 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MCM3P25205 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
MCM3P25205 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MCM3P25205 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MCM3P25205 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MCM3P25205 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MCM3P25205 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MCM3P25205 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MCM3P25205 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MCM3P25205 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MCM3P25205 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MCM3P25205 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms