Protein–RNA interactions for Protein: P17661

DES, Desmin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DESP17661 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DESP17661 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DESP17661 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DESP17661 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DESP17661 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DESP17661 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DESP17661 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DESP17661 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DESP17661 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DESP17661 SPOCK2-201ENST00000317376 5328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DESP17661 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DESP17661 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
DESP17661 ATE1-208ENST00000540606 5165 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DESP17661 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DESP17661 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DESP17661 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DESP17661 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DESP17661 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DESP17661 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DESP17661 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DESP17661 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DESP17661 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DESP17661 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DESP17661 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DESP17661 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DESP17661 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DESP17661 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DESP17661 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DESP17661 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DESP17661 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DESP17661 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
DESP17661 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DESP17661 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
DESP17661 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
DESP17661 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DESP17661 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
DESP17661 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DESP17661 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DESP17661 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DESP17661 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DESP17661 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DESP17661 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DESP17661 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DESP17661 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
DESP17661 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DESP17661 AC104129.1-202ENST00000480694 4481 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DESP17661 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DESP17661 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DESP17661 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DESP17661 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DESP17661 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DESP17661 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DESP17661 ZNF772-204ENST00000427512 5130 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DESP17661 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DESP17661 ABI2-202ENST00000261017 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DESP17661 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DESP17661 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DESP17661 PID1-202ENST00000392054 2745 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DESP17661 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
DESP17661 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DESP17661 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DESP17661 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DESP17661 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DESP17661 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DESP17661 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DESP17661 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DESP17661 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DESP17661 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DESP17661 ZNF654-204ENST00000636215 6446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DESP17661 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DESP17661 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DESP17661 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
DESP17661 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DESP17661 ARAP1-204ENST00000393609 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DESP17661 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DESP17661 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DESP17661 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DESP17661 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DESP17661 AL805961.2-201ENST00000642139 4817 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
DESP17661 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DESP17661 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DESP17661 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DESP17661 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DESP17661 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DESP17661 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DESP17661 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
DESP17661 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DESP17661 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DESP17661 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
DESP17661 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DESP17661 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DESP17661 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DESP17661 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
DESP17661 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DESP17661 NUMA1-233ENST00000616538 6998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DESP17661 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DESP17661 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DESP17661 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DESP17661 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DESP17661 CACNA1G-220ENST00000507896 6600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms