Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXI2

CNKSR2, Connector enhancer of kinase suppressor of ras 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,034 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNKSR2Q8WXI2 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CNKSR2Q8WXI2 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CNKSR2Q8WXI2 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CNKSR2Q8WXI2 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CNKSR2Q8WXI2 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNKSR2Q8WXI2 TPTE2P2-201ENST00000403471 1466 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CNKSR2Q8WXI2 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNKSR2Q8WXI2 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNKSR2Q8WXI2 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNKSR2Q8WXI2 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNKSR2Q8WXI2 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNKSR2Q8WXI2 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNKSR2Q8WXI2 FAM83A-AS1-202ENST00000520576 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNKSR2Q8WXI2 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CNKSR2Q8WXI2 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNKSR2Q8WXI2 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNKSR2Q8WXI2 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNKSR2Q8WXI2 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNKSR2Q8WXI2 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNKSR2Q8WXI2 AC007620.2-201ENST00000600539 1697 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNKSR2Q8WXI2 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNKSR2Q8WXI2 OR10D3-201ENST00000318666 1030 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNKSR2Q8WXI2 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNKSR2Q8WXI2 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNKSR2Q8WXI2 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNKSR2Q8WXI2 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNKSR2Q8WXI2 SET-205ENST00000409104 962 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNKSR2Q8WXI2 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNKSR2Q8WXI2 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNKSR2Q8WXI2 UBE2V1P7-201ENST00000446395 340 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CNKSR2Q8WXI2 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CNKSR2Q8WXI2 C1GALT1C1L-201ENST00000475092 1172 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNKSR2Q8WXI2 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNKSR2Q8WXI2 TMEM68-213ENST00000522576 826 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNKSR2Q8WXI2 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNKSR2Q8WXI2 AC124293.1-201ENST00000530034 493 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CNKSR2Q8WXI2 AP001893.1-201ENST00000532866 362 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNKSR2Q8WXI2 ASB8-203ENST00000535988 679 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNKSR2Q8WXI2 MAGOHB-204ENST00000539554 666 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNKSR2Q8WXI2 RAB6A-209ENST00000541973 1104 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNKSR2Q8WXI2 C3orf14-207ENST00000542214 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNKSR2Q8WXI2 AL133372.3-201ENST00000553082 821 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNKSR2Q8WXI2 BMS1P8-201ENST00000565049 1178 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CNKSR2Q8WXI2 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNKSR2Q8WXI2 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNKSR2Q8WXI2 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CNKSR2Q8WXI2 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNKSR2Q8WXI2 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNKSR2Q8WXI2 LARP7P1-201ENST00000605576 316 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CNKSR2Q8WXI2 BACH1-IT2-202ENST00000608072 691 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNKSR2Q8WXI2 AC079298.2-201ENST00000623885 459 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CNKSR2Q8WXI2 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNKSR2Q8WXI2 Z82209.2-201ENST00000623410 2012 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CNKSR2Q8WXI2 PPCDC-201ENST00000342932 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNKSR2Q8WXI2 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNKSR2Q8WXI2 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNKSR2Q8WXI2 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNKSR2Q8WXI2 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNKSR2Q8WXI2 DNMT3L-204ENST00000628202 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNKSR2Q8WXI2 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CNKSR2Q8WXI2 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNKSR2Q8WXI2 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNKSR2Q8WXI2 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNKSR2Q8WXI2 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNKSR2Q8WXI2 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNKSR2Q8WXI2 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CNKSR2Q8WXI2 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CNKSR2Q8WXI2 RBM4-202ENST00000396053 1337 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CNKSR2Q8WXI2 CADM2-202ENST00000405615 1314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CNKSR2Q8WXI2 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CNKSR2Q8WXI2 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CNKSR2Q8WXI2 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CNKSR2Q8WXI2 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CNKSR2Q8WXI2 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CNKSR2Q8WXI2 NAT1-208ENST00000520546 1446 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CNKSR2Q8WXI2 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CNKSR2Q8WXI2 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CNKSR2Q8WXI2 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CNKSR2Q8WXI2 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CNKSR2Q8WXI2 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CNKSR2Q8WXI2 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CNKSR2Q8WXI2 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CNKSR2Q8WXI2 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CNKSR2Q8WXI2 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CNKSR2Q8WXI2 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CNKSR2Q8WXI2 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CNKSR2Q8WXI2 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CNKSR2Q8WXI2 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CNKSR2Q8WXI2 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CNKSR2Q8WXI2 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CNKSR2Q8WXI2 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CNKSR2Q8WXI2 OR8J3-201ENST00000301529 948 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CNKSR2Q8WXI2 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CNKSR2Q8WXI2 TP53TG3C-201ENST00000360260 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CNKSR2Q8WXI2 OR13C3-201ENST00000374781 1108 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CNKSR2Q8WXI2 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CNKSR2Q8WXI2 AP002784.2-201ENST00000397300 549 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CNKSR2Q8WXI2 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CNKSR2Q8WXI2 DPYD-IT1-201ENST00000424982 401 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CNKSR2Q8WXI2 AC073508.1-201ENST00000428866 656 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
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