Protein–RNA interactions for Protein: Q12874

SF3A3, Splicing factor 3A subunit 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3A3Q12874 MTCH1-206ENST00000492754 373 ntTSL 516.67■□□□□ 0.265e-13■□□□□ 9.1
SF3A3Q12874 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.215e-13■□□□□ 9.1
SF3A3Q12874 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.215e-13■□□□□ 9.1
SF3A3Q12874 GLG1-206ENST00000562090 4037 ntTSL 215.56■□□□□ 0.085e-13■□□□□ 9.1
SF3A3Q12874 MIF-202ENST00000465752 589 ntTSL 1 (best)14.28□□□□□ -0.125e-13■□□□□ 9.1
SF3A3Q12874 MTCH1-205ENST00000471737 629 ntTSL 212.23□□□□□ -0.455e-13■□□□□ 9.1
SF3A3Q12874 LRPPRC-205ENST00000447246 1209 ntTSL 1 (best)12□□□□□ -0.495e-13■□□□□ 9.1
SF3A3Q12874 GLG1-211ENST00000566601 2536 ntTSL 210.53□□□□□ -0.725e-13■□□□□ 9.1
SF3A3Q12874 MTCH1-203ENST00000418541 602 ntTSL 37.55□□□□□ -1.25e-13■□□□□ 9.1
SF3A3Q12874 GLG1-207ENST00000563432 555 ntTSL 36.8□□□□□ -1.325e-13■□□□□ 9.1
SF3A3Q12874 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.171e-6■□□□□ 9.1
SF3A3Q12874 PLPP5-208ENST00000528814 1590 ntTSL 522.35■■□□□ 1.171e-6■□□□□ 9.1
SF3A3Q12874 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.151e-6■□□□□ 9.1
SF3A3Q12874 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.671e-6■□□□□ 9.1
SF3A3Q12874 PLPP5-205ENST00000524616 831 ntTSL 318.14■□□□□ 0.491e-6■□□□□ 9.1
SF3A3Q12874 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.121e-6■□□□□ 9.1
SF3A3Q12874 PLPP5-215ENST00000534339 745 ntTSL 515.77■□□□□ 0.121e-6■□□□□ 9.1
SF3A3Q12874 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.031e-6■□□□□ 9.1
SF3A3Q12874 PLPP5-212ENST00000531109 581 ntTSL 311.31□□□□□ -0.61e-6■□□□□ 9.1
SF3A3Q12874 PLPP5-207ENST00000527793 392 ntTSL 35.77□□□□□ -1.491e-6■□□□□ 9.1
SF3A3Q12874 DYNC1LI2-209ENST00000565532 744 ntTSL 510.15□□□□□ -0.782e-15■□□□□ 9.1
SF3A3Q12874 DYNC1LI2-208ENST00000564833 727 ntTSL 49.13□□□□□ -0.952e-15■□□□□ 9.1
SF3A3Q12874 DYNC1LI2-211ENST00000567499 3994 ntTSL 27.85□□□□□ -1.152e-15■□□□□ 9.1
SF3A3Q12874 COL9A3-212ENST00000481800 548 ntTSL 415.48■□□□□ 0.078e-22■□□□□ 9.1
SF3A3Q12874 RBM39-236ENST00000490484 871 ntTSL 59.05□□□□□ -0.962e-48■□□□□ 9
SF3A3Q12874 RBM39-229ENST00000475651 555 ntTSL 54.34□□□□□ -1.712e-48■□□□□ 9
SF3A3Q12874 TRIM24-206ENST00000497516 1515 ntTSL 513.57□□□□□ -0.243e-9■□□□□ 9
SF3A3Q12874 TAF1C-207ENST00000562445 259 ntTSL 312.33□□□□□ -0.448e-15■□□□□ 9
SF3A3Q12874 FASN-209ENST00000636628 100 ntTSL 54.43□□□□□ -1.75e-18■□□□□ 9
SF3A3Q12874 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.352e-13■□□□□ 9
SF3A3Q12874 RNU6-6P-201ENST00000606623 107 ntBASIC3.14□□□□□ -1.913e-9■□□□□ 9
SF3A3Q12874 SGPL1-204ENST00000486993 537 ntTSL 1 (best)18.39■□□□□ 0.532e-33■□□□□ 9
SF3A3Q12874 CDC37-207ENST00000589755 793 ntTSL 219.04■□□□□ 0.647e-12■□□□□ 9
SF3A3Q12874 CDC37-210ENST00000593124 1389 ntTSL 517.02■□□□□ 0.327e-12■□□□□ 9
SF3A3Q12874 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.057e-12■□□□□ 9
SF3A3Q12874 CDC37-202ENST00000588498 690 ntTSL 314.68□□□□□ -0.067e-12■□□□□ 9
SF3A3Q12874 CDC37-203ENST00000588869 966 ntTSL 514.2□□□□□ -0.147e-12■□□□□ 9
SF3A3Q12874 CDC37-206ENST00000589629 728 ntTSL 313.94□□□□□ -0.187e-12■□□□□ 9
SF3A3Q12874 CDC37-209ENST00000591248 1377 ntTSL 513.67□□□□□ -0.227e-12■□□□□ 9
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SF3A3Q12874 IP6K2-214ENST00000436134 631 ntTSL 311.15□□□□□ -0.627e-12■□□□□ 9
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SF3A3Q12874 IP6K2-223ENST00000453202 571 ntTSL 4 BASIC10.67□□□□□ -0.77e-12■□□□□ 9
SF3A3Q12874 IP6K2-218ENST00000443964 973 ntTSL 4 BASIC10.39□□□□□ -0.757e-12■□□□□ 9
SF3A3Q12874 IP6K2-208ENST00000417896 1124 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.757e-12■□□□□ 9
SF3A3Q12874 SMYD2-205ENST00000484459 463 ntTSL 34.43□□□□□ -1.74e-6■□□□□ 9
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SF3A3Q12874 RALGAPA1-206ENST00000554259 3354 ntTSL 52.55□□□□□ -22e-7■□□□□ 9
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SF3A3Q12874 UBA1-205ENST00000427561 671 ntTSL 511.7□□□□□ -0.541e-14■□□□□ 9
SF3A3Q12874 UBA1-207ENST00000451702 1706 ntTSL 510.84□□□□□ -0.671e-14■□□□□ 9
SF3A3Q12874 AJUBA-207ENST00000555479 558 ntTSL 410.29□□□□□ -0.762e-6■□□□□ 8.9
SF3A3Q12874 HNRNPA2B1-205ENST00000476233 1220 ntTSL 1 (best)6.03□□□□□ -1.448e-22■□□□□ 8.9
SF3A3Q12874 EIF1-204ENST00000469308 815 ntTSL 220.07■□□□□ 0.85e-7■□□□□ 8.9
SF3A3Q12874 EIF1-202ENST00000462917 2170 ntTSL 1 (best)19.22■□□□□ 0.675e-7■□□□□ 8.9
SF3A3Q12874 PLA2G4B-203ENST00000461382 1530 ntTSL 217.31■□□□□ 0.365e-7■□□□□ 8.9
SF3A3Q12874 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.175e-7■□□□□ 8.9
SF3A3Q12874 JMJD7-PLA2G4B-205ENST00000490848 7218 ntTSL 215.96■□□□□ 0.155e-7■□□□□ 8.9
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SF3A3Q12874 JMJD7-PLA2G4B-203ENST00000476036 577 ntTSL 513.7□□□□□ -0.225e-7■□□□□ 8.9
SF3A3Q12874 JMJD7-PLA2G4B-202ENST00000382448 3331 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.245e-7■□□□□ 8.9
SF3A3Q12874 JMJD7-PLA2G4B-206ENST00000491746 7227 ntTSL 213.33□□□□□ -0.285e-7■□□□□ 8.9
SF3A3Q12874 JMJD7-PLA2G4B-201ENST00000342159 2966 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.395e-7■□□□□ 8.9
SF3A3Q12874 JMJD7-PLA2G4B-204ENST00000487292 3178 ntTSL 212.53□□□□□ -0.45e-7■□□□□ 8.9
SF3A3Q12874 EIF1-201ENST00000310837 1120 ntTSL 1 (best)7.7□□□□□ -1.185e-7■□□□□ 8.9
SF3A3Q12874 RBL2-203ENST00000544405 2025 ntTSL 27.52□□□□□ -1.25e-7■□□□□ 8.9
SF3A3Q12874 EIF1-203ENST00000469257 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.265e-7■□□□□ 8.9
SF3A3Q12874 EIF1-207ENST00000591776 797 ntTSL 4 BASIC6.78□□□□□ -1.325e-7■□□□□ 8.9
SF3A3Q12874 EIF1-205ENST00000482111 1428 ntTSL 25.99□□□□□ -1.455e-7■□□□□ 8.9
SF3A3Q12874 RBL2-205ENST00000562837 738 ntTSL 44.62□□□□□ -1.675e-7■□□□□ 8.9
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SF3A3Q12874 RHBG-203ENST00000494874 324 ntTSL 310.32□□□□□ -0.761e-47■□□□□ 8.9
SF3A3Q12874 HNRNPL-203ENST00000595164 2404 ntTSL 214.3□□□□□ -0.125e-13■□□□□ 8.9
SF3A3Q12874 HNRNPL-206ENST00000597731 3094 ntTSL 210.96□□□□□ -0.655e-13■□□□□ 8.9
SF3A3Q12874 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.248e-13■□□□□ 8.9
SF3A3Q12874 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.131e-6■□□□□ 8.9
SF3A3Q12874 TCP1-214ENST00000543532 561 ntTSL 421.11■□□□□ 0.971e-6■□□□□ 8.9
SF3A3Q12874 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.311e-6■□□□□ 8.9
SF3A3Q12874 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.011e-6■□□□□ 8.9
SF3A3Q12874 TCP1-211ENST00000539756 780 ntTSL 314.19□□□□□ -0.141e-6■□□□□ 8.9
SF3A3Q12874 TCP1-210ENST00000538530 918 ntTSL 514.1□□□□□ -0.151e-6■□□□□ 8.9
SF3A3Q12874 TCP1-215ENST00000544255 1403 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.431e-6■□□□□ 8.9
SF3A3Q12874 GID8-201ENST00000266069 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.662e-6■□□□□ 8.9
SF3A3Q12874 BRIP1-205ENST00000583837 449 ntTSL 59.95□□□□□ -0.823e-7■□□□□ 8.9
SF3A3Q12874 BRIP1-204ENST00000579028 790 ntTSL 56.82□□□□□ -1.323e-7■□□□□ 8.9
SF3A3Q12874 BRIP1-201ENST00000259008 6048 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.323e-7■□□□□ 8.9
SF3A3Q12874 BRIP1-202ENST00000577598 3969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.533e-7■□□□□ 8.9
SF3A3Q12874 USP36-221ENST00000592231 2479 ntTSL 214.88□□□□□ -0.033e-8■□□□□ 8.9
SF3A3Q12874 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.053e-8■□□□□ 8.9
SF3A3Q12874 SRRT-209ENST00000474896 726 ntTSL 313.84□□□□□ -0.193e-8■□□□□ 8.9
SF3A3Q12874 PABPC4-213ENST00000482028 633 ntTSL 212.87□□□□□ -0.353e-8■□□□□ 8.9
SF3A3Q12874 USP36-207ENST00000587010 607 ntTSL 312.23□□□□□ -0.453e-8■□□□□ 8.9
SF3A3Q12874 USP36-208ENST00000587379 606 ntTSL 39.6□□□□□ -0.873e-8■□□□□ 8.9
SF3A3Q12874 USP36-219ENST00000591052 427 ntTSL 39.12□□□□□ -0.953e-8■□□□□ 8.9
SF3A3Q12874 PABPC4-224ENST00000530186 352 ntTSL 25.61□□□□□ -1.513e-8■□□□□ 8.9
SF3A3Q12874 TBCK-208ENST00000503832 865 ntTSL 54.95□□□□□ -1.623e-8■□□□□ 8.9
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