Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW72

HIGD2A, HIG1 domain family member 2A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD2AQ9BW72 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC9.3□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 UNC13D-201ENST00000207549 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 NOS3-201ENST00000297494 4388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 TRPC6-201ENST00000344327 4612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 FANCC-202ENST00000375305 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 RPL15-213ENST00000611050 2363 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.3□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 RGS12-202ENST00000338806 3010 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 GALNT7-201ENST00000265000 4307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 KIAA0895-203ENST00000338533 4132 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 EGR2-202ENST00000411732 2824 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 LRRN2-201ENST00000367175 5036 ntAPPRIS P1 BASIC9.3□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 GRM4-204ENST00000535756 6670 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 STARD8-203ENST00000374599 4841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 TAB2-208ENST00000636456 3092 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 IRF2BPL-201ENST00000238647 4157 ntAPPRIS P1 BASIC9.3□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 PABPC1-208ENST00000519004 2401 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 EPB41L5-201ENST00000263713 6628 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 HNRNPDL-207ENST00000614627 3968 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 AHI1-205ENST00000457866 5549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 KCNA1-201ENST00000382545 7997 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.3□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 SLC35B4-201ENST00000378509 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 GRHL2-201ENST00000251808 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 KCNAB2-206ENST00000378097 4201 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 ZBTB7B-203ENST00000417934 4017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 SAMD15-201ENST00000216471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 NRROS-201ENST00000328557 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 SLC22A2-202ENST00000366953 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 DHX34-201ENST00000328771 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 ARHGEF10-205ENST00000518288 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 RRBP1-202ENST00000360807 3727 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 STRA6-202ENST00000395105 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 KIAA0319-205ENST00000543707 5314 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 NTM-202ENST00000374786 3190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 PCDHGB1-201ENST00000523390 4590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 FAM225B-201ENST00000423546 5629 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC9.29□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC9.29□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC9.29□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms