Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 AC244197.3-201ENST00000422081 2635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 ARHGAP25-203ENST00000409220 2939 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 AC241585.2-201ENST00000578899 2307 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 PNPLA8-208ENST00000453144 3366 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 PTGER4P2-CDK2AP2P2-201ENST00000619442 3123 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 AL359915.2-202ENST00000440150 2469 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 FAM71E2-201ENST00000424985 3191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 EHD1-213ENST00000621096 3336 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 ACVRL1-206ENST00000550683 4121 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 MEAF6-203ENST00000373074 2005 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC11.31□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82 ms