Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 ELK1-201ENST00000247161 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SEC23BQ15437 CDH16-204ENST00000565796 2694 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SEC23BQ15437 INMT-201ENST00000013222 2559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SEC23BQ15437 SAMD15-201ENST00000216471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SEC23BQ15437 ANKS1B-208ENST00000547010 2595 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SEC23BQ15437 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SEC23BQ15437 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SEC23BQ15437 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SEC23BQ15437 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SEC23BQ15437 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SEC23BQ15437 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SEC23BQ15437 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SEC23BQ15437 TNS2-219ENST00000552570 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SEC23BQ15437 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SEC23BQ15437 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SEC23BQ15437 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SEC23BQ15437 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
SEC23BQ15437 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SEC23BQ15437 HNRNPUL1-204ENST00000392006 3555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SEC23BQ15437 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SEC23BQ15437 ACADM-218ENST00000541113 2535 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SEC23BQ15437 ZC2HC1A-201ENST00000263849 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SEC23BQ15437 IL20RA-207ENST00000541547 3382 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SEC23BQ15437 TFAM-204ENST00000487519 5414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SEC23BQ15437 RBBP8NL-201ENST00000252998 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SEC23BQ15437 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SEC23BQ15437 KLHL13-204ENST00000371882 3256 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SEC23BQ15437 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SEC23BQ15437 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SEC23BQ15437 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SEC23BQ15437 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SEC23BQ15437 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SEC23BQ15437 AL139193.2-201ENST00000553712 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SEC23BQ15437 VASH2-202ENST00000366964 2960 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SEC23BQ15437 ATP2C1-201ENST00000328560 3484 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SEC23BQ15437 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SEC23BQ15437 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SEC23BQ15437 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SEC23BQ15437 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SEC23BQ15437 PPP3R1-201ENST00000234310 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SEC23BQ15437 NDRG4-221ENST00000563799 3014 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SEC23BQ15437 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SEC23BQ15437 TMEM63B-202ENST00000323267 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SEC23BQ15437 IFNA6-202ENST00000380210 1544 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SEC23BQ15437 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SEC23BQ15437 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SEC23BQ15437 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SEC23BQ15437 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SEC23BQ15437 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SEC23BQ15437 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SEC23BQ15437 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SEC23BQ15437 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SEC23BQ15437 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SEC23BQ15437 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SEC23BQ15437 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
SEC23BQ15437 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
SEC23BQ15437 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SEC23BQ15437 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
SEC23BQ15437 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
SEC23BQ15437 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SEC23BQ15437 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SEC23BQ15437 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SEC23BQ15437 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SEC23BQ15437 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SEC23BQ15437 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SEC23BQ15437 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
SEC23BQ15437 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SEC23BQ15437 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SEC23BQ15437 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SEC23BQ15437 PNRC2-201ENST00000334351 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SEC23BQ15437 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SEC23BQ15437 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SEC23BQ15437 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SEC23BQ15437 UACA-201ENST00000322954 6939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SEC23BQ15437 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SEC23BQ15437 COLGALT1-201ENST00000252599 3704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SEC23BQ15437 SPATA20-227ENST00000634597 2587 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SEC23BQ15437 IKBKG-208ENST00000611176 1654 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SEC23BQ15437 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
SEC23BQ15437 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SEC23BQ15437 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SEC23BQ15437 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SEC23BQ15437 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SEC23BQ15437 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SEC23BQ15437 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SEC23BQ15437 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SEC23BQ15437 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SEC23BQ15437 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SEC23BQ15437 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SEC23BQ15437 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SEC23BQ15437 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
SEC23BQ15437 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SEC23BQ15437 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SEC23BQ15437 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SEC23BQ15437 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SEC23BQ15437 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SEC23BQ15437 CCDC57-203ENST00000392343 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SEC23BQ15437 NDRG2-251ENST00000556147 2880 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SEC23BQ15437 NUTM2HP-201ENST00000442076 2498 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
SEC23BQ15437 SAFB-211ENST00000592224 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.5 ms