Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ME1P48163 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ME1P48163 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ME1P48163 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ME1P48163 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ME1P48163 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ME1P48163 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ME1P48163 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ME1P48163 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ME1P48163 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ME1P48163 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ME1P48163 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ME1P48163 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ME1P48163 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ME1P48163 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ME1P48163 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ME1P48163 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ME1P48163 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ME1P48163 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ME1P48163 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ME1P48163 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ME1P48163 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ME1P48163 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ME1P48163 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ME1P48163 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ME1P48163 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ME1P48163 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ME1P48163 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ME1P48163 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ME1P48163 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ME1P48163 AC011298.1-201ENST00000407635 3398 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ME1P48163 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ME1P48163 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ME1P48163 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ME1P48163 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ME1P48163 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ME1P48163 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ME1P48163 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ME1P48163 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ME1P48163 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ME1P48163 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ME1P48163 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ME1P48163 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ME1P48163 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ME1P48163 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ME1P48163 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ME1P48163 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ME1P48163 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ME1P48163 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ME1P48163 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ME1P48163 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ME1P48163 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ME1P48163 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ME1P48163 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ME1P48163 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ME1P48163 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ME1P48163 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ME1P48163 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ME1P48163 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ME1P48163 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ME1P48163 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ME1P48163 EDC3-201ENST00000315127 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ME1P48163 COBL-205ENST00000441453 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ME1P48163 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ME1P48163 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ME1P48163 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ME1P48163 TRIB2-201ENST00000155926 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ME1P48163 ATN1-201ENST00000356654 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ME1P48163 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ME1P48163 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ME1P48163 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ME1P48163 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ME1P48163 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ME1P48163 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ME1P48163 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ME1P48163 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ME1P48163 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ME1P48163 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ME1P48163 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ME1P48163 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ME1P48163 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ME1P48163 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ME1P48163 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ME1P48163 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ME1P48163 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ME1P48163 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ME1P48163 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ME1P48163 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ME1P48163 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ME1P48163 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ME1P48163 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ME1P48163 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ME1P48163 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ME1P48163 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ME1P48163 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ME1P48163 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ME1P48163 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ME1P48163 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ME1P48163 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ME1P48163 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms