Protein–RNA interactions for Protein: P46531

NOTCH1, Neurogenic locus notch homolog protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,555 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTCH1P46531 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
NOTCH1P46531 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
NOTCH1P46531 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
NOTCH1P46531 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
NOTCH1P46531 AL365181.1-201ENST00000564032 1828 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
NOTCH1P46531 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
NOTCH1P46531 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
NOTCH1P46531 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
NOTCH1P46531 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
NOTCH1P46531 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
NOTCH1P46531 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
NOTCH1P46531 TEX36-AS1-202ENST00000446081 749 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
NOTCH1P46531 RN7SL788P-201ENST00000460504 316 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
NOTCH1P46531 AC025594.1-201ENST00000469533 543 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
NOTCH1P46531 AC122694.1-201ENST00000510987 563 ntTSL 4 BASIC10.59□□□□□ -0.71
NOTCH1P46531 AC116025.1-201ENST00000575404 415 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
NOTCH1P46531 AC003688.2-201ENST00000576271 415 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
NOTCH1P46531 AC113385.2-201ENST00000614465 762 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
NOTCH1P46531 RARS-210ENST00000626454 177 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
NOTCH1P46531 BX322534.1-201ENST00000635574 241 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
NOTCH1P46531 AC215524.1-201ENST00000635696 241 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
NOTCH1P46531 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
NOTCH1P46531 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
NOTCH1P46531 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
NOTCH1P46531 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
NOTCH1P46531 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
NOTCH1P46531 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
NOTCH1P46531 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
NOTCH1P46531 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
NOTCH1P46531 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
NOTCH1P46531 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
NOTCH1P46531 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
NOTCH1P46531 FAM226B-201ENST00000602508 1490 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
NOTCH1P46531 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
NOTCH1P46531 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
NOTCH1P46531 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
NOTCH1P46531 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
NOTCH1P46531 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
NOTCH1P46531 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
NOTCH1P46531 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
NOTCH1P46531 RPAIN-202ENST00000381208 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
NOTCH1P46531 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
NOTCH1P46531 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
NOTCH1P46531 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
NOTCH1P46531 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
NOTCH1P46531 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
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NOTCH1P46531 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
NOTCH1P46531 HPGD-201ENST00000296521 1171 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
NOTCH1P46531 SIRPB3P-201ENST00000340424 1216 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
NOTCH1P46531 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
NOTCH1P46531 AC231533.1-201ENST00000416061 925 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
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NOTCH1P46531 SAPCD1-AS1-202ENST00000419679 461 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
NOTCH1P46531 AL359092.2-201ENST00000423330 585 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
NOTCH1P46531 KRT18P62-201ENST00000446618 1287 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
NOTCH1P46531 SMIM15-202ENST00000507416 584 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
NOTCH1P46531 MBP-230ENST00000528160 584 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
NOTCH1P46531 AC087203.1-201ENST00000532111 1181 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
NOTCH1P46531 SLC25A3-215ENST00000551265 580 ntTSL 4 BASIC10.59□□□□□ -0.71
NOTCH1P46531 AC023825.2-201ENST00000562970 672 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
NOTCH1P46531 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
NOTCH1P46531 SARS-202ENST00000369923 1882 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
NOTCH1P46531 TBC1D3P2-201ENST00000339120 1513 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
NOTCH1P46531 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
NOTCH1P46531 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
NOTCH1P46531 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
NOTCH1P46531 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
NOTCH1P46531 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
NOTCH1P46531 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
NOTCH1P46531 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
NOTCH1P46531 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
NOTCH1P46531 CAB39L-204ENST00000409130 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
NOTCH1P46531 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
NOTCH1P46531 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
NOTCH1P46531 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
NOTCH1P46531 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
NOTCH1P46531 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
NOTCH1P46531 LINC00205-201ENST00000433465 1391 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
NOTCH1P46531 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
NOTCH1P46531 SLC6A10P-201ENST00000330048 3846 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
NOTCH1P46531 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
NOTCH1P46531 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
NOTCH1P46531 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
NOTCH1P46531 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
NOTCH1P46531 SSR4-202ENST00000370085 526 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
NOTCH1P46531 OR7E115P-201ENST00000382617 1024 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
NOTCH1P46531 GGTLC4P-201ENST00000402176 664 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
NOTCH1P46531 AC006987.1-201ENST00000413610 527 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
NOTCH1P46531 AC073210.1-201ENST00000414799 232 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
NOTCH1P46531 RPL18AP16-201ENST00000424057 531 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
NOTCH1P46531 CITED1-209ENST00000453707 998 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
NOTCH1P46531 RNASEH2CP1-201ENST00000454281 502 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
NOTCH1P46531 TREX1-203ENST00000456089 629 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
NOTCH1P46531 AC092910.2-201ENST00000491262 348 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
NOTCH1P46531 AAMDC-210ENST00000532481 690 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
NOTCH1P46531 GLT8D2-204ENST00000547583 862 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
NOTCH1P46531 PRR13-209ENST00000549924 625 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
NOTCH1P46531 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
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