Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

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Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRCP08575 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRCP08575 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRCP08575 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRCP08575 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRCP08575 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRCP08575 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRCP08575 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRCP08575 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRCP08575 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRCP08575 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRCP08575 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRCP08575 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRCP08575 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRCP08575 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRCP08575 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRCP08575 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRCP08575 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRCP08575 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRCP08575 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRCP08575 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRCP08575 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PTPRCP08575 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
PTPRCP08575 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
PTPRCP08575 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 USP39-207ENST00000450066 2086 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 AL590824.1-201ENST00000403828 1349 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 SLC5A4-AS1-201ENST00000434942 876 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 ELP4-228ENST00000640954 1612 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
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