Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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GRIK2Q13002 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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GRIK2Q13002 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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GRIK2Q13002 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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