Protein–RNA interactions for Protein: P15509

CSF2RA, Granulocyte-macrophage colony-stimulating factor receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF2RAP15509 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSF2RAP15509 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSF2RAP15509 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSF2RAP15509 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSF2RAP15509 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSF2RAP15509 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSF2RAP15509 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSF2RAP15509 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSF2RAP15509 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSF2RAP15509 PDE4C-204ENST00000539010 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSF2RAP15509 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSF2RAP15509 CLCC1-202ENST00000348264 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSF2RAP15509 OR10N1P-201ENST00000392758 869 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CSF2RAP15509 RPL3P2-204ENST00000413027 1203 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CSF2RAP15509 AL132657.1-201ENST00000432530 712 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSF2RAP15509 NRADDP-201ENST00000437305 691 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CSF2RAP15509 HNRNPA1P42-201ENST00000458678 957 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CSF2RAP15509 C21orf62-204ENST00000490358 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSF2RAP15509 TPP1-209ENST00000528657 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSF2RAP15509 AC012617.1-201ENST00000586345 797 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSF2RAP15509 SMAD7-208ENST00000591805 1152 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSF2RAP15509 LINC02333-201ENST00000603464 852 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSF2RAP15509 LINC01869-204ENST00000635639 1047 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSF2RAP15509 AC062028.1-201ENST00000536743 1422 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSF2RAP15509 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSF2RAP15509 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSF2RAP15509 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSF2RAP15509 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSF2RAP15509 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSF2RAP15509 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSF2RAP15509 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSF2RAP15509 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSF2RAP15509 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSF2RAP15509 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSF2RAP15509 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSF2RAP15509 SLC25A31-201ENST00000281154 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSF2RAP15509 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSF2RAP15509 UBE2L5P-202ENST00000635918 1513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSF2RAP15509 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSF2RAP15509 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSF2RAP15509 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSF2RAP15509 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSF2RAP15509 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSF2RAP15509 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSF2RAP15509 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSF2RAP15509 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSF2RAP15509 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSF2RAP15509 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSF2RAP15509 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSF2RAP15509 HIST1H2BK-201ENST00000356950 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSF2RAP15509 NDUFB6-202ENST00000366466 761 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSF2RAP15509 IGHV1-3-201ENST00000390595 395 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSF2RAP15509 PEMT-204ENST00000395783 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSF2RAP15509 PLSCR1-202ENST00000448787 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSF2RAP15509 CU639417.1-201ENST00000464664 460 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSF2RAP15509 PAQR9-AS1-203ENST00000497652 516 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSF2RAP15509 AC093300.1-201ENST00000510368 1201 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CSF2RAP15509 EXTL3-AS1-203ENST00000520023 780 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSF2RAP15509 LZTS1-AS1-201ENST00000523103 892 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSF2RAP15509 BAK1P2-201ENST00000532665 631 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CSF2RAP15509 BID-209ENST00000551952 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSF2RAP15509 RN7SL455P-201ENST00000580629 282 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CSF2RAP15509 AC008735.2-201ENST00000589456 549 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSF2RAP15509 ZNF737-204ENST00000596797 569 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSF2RAP15509 KXD1-211ENST00000599319 707 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSF2RAP15509 H2BFS-201ENST00000599962 460 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSF2RAP15509 AC016586.1-201ENST00000600056 684 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSF2RAP15509 AL136982.5-201ENST00000605222 294 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CSF2RAP15509 AC011462.4-201ENST00000616866 449 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CSF2RAP15509 CCL3L3-203ENST00000619989 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSF2RAP15509 AC073869.4-201ENST00000620841 800 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CSF2RAP15509 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSF2RAP15509 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSF2RAP15509 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSF2RAP15509 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSF2RAP15509 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSF2RAP15509 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSF2RAP15509 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSF2RAP15509 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSF2RAP15509 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSF2RAP15509 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSF2RAP15509 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSF2RAP15509 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSF2RAP15509 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSF2RAP15509 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSF2RAP15509 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSF2RAP15509 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSF2RAP15509 DNAJB13-201ENST00000339764 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSF2RAP15509 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSF2RAP15509 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSF2RAP15509 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSF2RAP15509 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSF2RAP15509 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSF2RAP15509 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSF2RAP15509 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSF2RAP15509 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSF2RAP15509 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSF2RAP15509 CRYM-202ENST00000543948 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSF2RAP15509 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSF2RAP15509 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.2 ms