Protein–RNA interactions for Protein: O60308

CEP104, Centrosomal protein of 104 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP104O60308 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEP104O60308 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEP104O60308 FER1L4-204ENST00000430275 3281 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEP104O60308 JUN-201ENST00000371222 3540 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEP104O60308 MTMR3-204ENST00000401950 6018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEP104O60308 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEP104O60308 KCNJ9-201ENST00000368088 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEP104O60308 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEP104O60308 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEP104O60308 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEP104O60308 PLIN4-201ENST00000301286 6353 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEP104O60308 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEP104O60308 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CEP104O60308 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CEP104O60308 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEP104O60308 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEP104O60308 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEP104O60308 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEP104O60308 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEP104O60308 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CEP104O60308 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEP104O60308 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEP104O60308 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEP104O60308 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEP104O60308 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEP104O60308 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEP104O60308 INMT-201ENST00000013222 2559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEP104O60308 NAP1L2-201ENST00000373517 2550 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEP104O60308 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEP104O60308 DLGAP4-202ENST00000340491 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEP104O60308 AGAP5-201ENST00000374094 2394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEP104O60308 HSPH1-202ENST00000380405 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEP104O60308 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEP104O60308 MAP7-202ENST00000432797 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEP104O60308 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CEP104O60308 KLHL9-201ENST00000359039 5710 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEP104O60308 REC8-213ENST00000620473 2405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEP104O60308 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CEP104O60308 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEP104O60308 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEP104O60308 AC019294.4-201ENST00000561777 2905 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CEP104O60308 AL356275.1-201ENST00000638446 7440 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEP104O60308 NFKB1-201ENST00000226574 4085 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEP104O60308 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEP104O60308 BRPF1-205ENST00000433861 4304 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEP104O60308 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEP104O60308 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEP104O60308 PBRM1-204ENST00000394830 5071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEP104O60308 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEP104O60308 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEP104O60308 WASHC2A-209ENST00000611324 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEP104O60308 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEP104O60308 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEP104O60308 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEP104O60308 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEP104O60308 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEP104O60308 PLEKHB2-205ENST00000409279 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEP104O60308 NUTM2HP-201ENST00000442076 2498 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CEP104O60308 HIPK1-205ENST00000369558 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEP104O60308 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEP104O60308 IL12RB1-203ENST00000593993 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEP104O60308 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEP104O60308 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CEP104O60308 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEP104O60308 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CEP104O60308 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEP104O60308 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CEP104O60308 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEP104O60308 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEP104O60308 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEP104O60308 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEP104O60308 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEP104O60308 RAVER1-206ENST00000611074 3586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEP104O60308 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEP104O60308 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CEP104O60308 SLC35D1-201ENST00000235345 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEP104O60308 VASH2-202ENST00000366964 2960 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEP104O60308 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEP104O60308 MOG-221ENST00000376917 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEP104O60308 KIAA0895-203ENST00000338533 4132 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEP104O60308 NDRG4-221ENST00000563799 3014 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEP104O60308 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEP104O60308 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CEP104O60308 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CEP104O60308 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CEP104O60308 SPATA20-227ENST00000634597 2587 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CEP104O60308 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CEP104O60308 TMEM63B-202ENST00000323267 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CEP104O60308 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CEP104O60308 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CEP104O60308 DCAF8L2-203ENST00000545306 2013 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CEP104O60308 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CEP104O60308 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CEP104O60308 WNK1-201ENST00000315939 10452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CEP104O60308 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CEP104O60308 TCHH-202ENST00000614923 6995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CEP104O60308 DCAF8-201ENST00000326837 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CEP104O60308 PPFIA4-203ENST00000367240 6434 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CEP104O60308 STK3-218ENST00000617590 2485 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CEP104O60308 PDK2-203ENST00000503176 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms