Protein–RNA interactions for Protein: O43583

DENR, Density-regulated protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENRO43583 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DENRO43583 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DENRO43583 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DENRO43583 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
DENRO43583 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
DENRO43583 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
DENRO43583 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DENRO43583 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
DENRO43583 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
DENRO43583 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
DENRO43583 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
DENRO43583 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
DENRO43583 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
DENRO43583 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
DENRO43583 NFATC2IP-206ENST00000568148 1157 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
DENRO43583 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
DENRO43583 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DENRO43583 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
DENRO43583 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
DENRO43583 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
DENRO43583 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
DENRO43583 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
DENRO43583 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
DENRO43583 DCAF12L1-201ENST00000371126 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DENRO43583 PDCD6IPP2-206ENST00000566178 3351 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
DENRO43583 ZCCHC18-206ENST00000611638 2941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
DENRO43583 ARAF-203ENST00000377045 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DENRO43583 EFHC2-202ENST00000420999 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DENRO43583 FLNC-201ENST00000325888 9188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DENRO43583 WNK1-201ENST00000315939 10452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DENRO43583 SLC6A9-205ENST00000372310 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
DENRO43583 AC068580.3-201ENST00000449248 2015 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DENRO43583 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
DENRO43583 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DENRO43583 RIPK4-201ENST00000332512 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DENRO43583 GRM1-202ENST00000355289 3874 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DENRO43583 CCDC117-201ENST00000249064 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DENRO43583 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
DENRO43583 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
DENRO43583 COPS7B-201ENST00000350033 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DENRO43583 DRG2-202ENST00000395726 1897 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
DENRO43583 SCAF4-202ENST00000399804 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DENRO43583 LAIR1-204ENST00000391743 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.27
DENRO43583 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
DENRO43583 TBC1D24-201ENST00000293970 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
DENRO43583 GRIPAP1-207ENST00000593475 2908 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
DENRO43583 TNS2-203ENST00000379902 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DENRO43583 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DENRO43583 SERPINH1-205ENST00000525876 2283 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
DENRO43583 CYTH1-203ENST00000585509 3315 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
DENRO43583 TRPM4-202ENST00000427978 3444 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DENRO43583 LSM14A-201ENST00000433627 3424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DENRO43583 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DENRO43583 ALDH3A2-201ENST00000176643 3928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DENRO43583 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DENRO43583 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DENRO43583 AL031687.1-201ENST00000450586 2137 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
DENRO43583 FAM53B-203ENST00000392754 3557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
DENRO43583 SOAT1-204ENST00000540564 6861 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DENRO43583 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DENRO43583 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DENRO43583 INPP5J-201ENST00000331075 3347 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
DENRO43583 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
DENRO43583 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
DENRO43583 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
DENRO43583 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
DENRO43583 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
DENRO43583 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
DENRO43583 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
DENRO43583 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
DENRO43583 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
DENRO43583 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
DENRO43583 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
DENRO43583 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
DENRO43583 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
DENRO43583 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
DENRO43583 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DENRO43583 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
DENRO43583 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
DENRO43583 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DENRO43583 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DENRO43583 CKMT2-203ENST00000437669 1479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
DENRO43583 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
DENRO43583 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DENRO43583 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DENRO43583 GNAL-203ENST00000423027 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DENRO43583 ELMOD3-206ENST00000409890 2492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
DENRO43583 BCL2L1-203ENST00000376062 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DENRO43583 KIF9-207ENST00000444589 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DENRO43583 CCDC187-203ENST00000569961 3158 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DENRO43583 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
DENRO43583 KCNMA1-210ENST00000404771 4014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
DENRO43583 CDHR5-202ENST00000358353 3635 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
DENRO43583 S1PR1-201ENST00000305352 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DENRO43583 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DENRO43583 HLA-E-201ENST00000376630 2601 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
DENRO43583 ZNF302-203ENST00000457781 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DENRO43583 TMOD1-202ENST00000375175 2516 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
DENRO43583 PI4KA-201ENST00000255882 6752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DENRO43583 SPIN3-245ENST00000640768 1722 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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