Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQP3

TNN, Tenascin-N, humanhuman

Predictions only

Length 1,299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNQ9UQP3 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
TNNQ9UQP3 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TNNQ9UQP3 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TNNQ9UQP3 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
TNNQ9UQP3 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TNNQ9UQP3 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TNNQ9UQP3 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TNNQ9UQP3 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TNNQ9UQP3 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TNNQ9UQP3 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TNNQ9UQP3 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TNNQ9UQP3 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
TNNQ9UQP3 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TNNQ9UQP3 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TNNQ9UQP3 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TNNQ9UQP3 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TNNQ9UQP3 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TNNQ9UQP3 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TNNQ9UQP3 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TNNQ9UQP3 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TNNQ9UQP3 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TNNQ9UQP3 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TNNQ9UQP3 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TNNQ9UQP3 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TNNQ9UQP3 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TNNQ9UQP3 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
TNNQ9UQP3 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
TNNQ9UQP3 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
TNNQ9UQP3 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
TNNQ9UQP3 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
TNNQ9UQP3 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
TNNQ9UQP3 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TNNQ9UQP3 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TNNQ9UQP3 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TNNQ9UQP3 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TNNQ9UQP3 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TNNQ9UQP3 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TNNQ9UQP3 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TNNQ9UQP3 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TNNQ9UQP3 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TNNQ9UQP3 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TNNQ9UQP3 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TNNQ9UQP3 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TNNQ9UQP3 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TNNQ9UQP3 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
TNNQ9UQP3 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TNNQ9UQP3 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TNNQ9UQP3 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TNNQ9UQP3 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TNNQ9UQP3 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TNNQ9UQP3 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TNNQ9UQP3 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TNNQ9UQP3 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TNNQ9UQP3 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TNNQ9UQP3 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TNNQ9UQP3 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TNNQ9UQP3 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TNNQ9UQP3 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
TNNQ9UQP3 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
TNNQ9UQP3 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TNNQ9UQP3 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
TNNQ9UQP3 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TNNQ9UQP3 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TNNQ9UQP3 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
TNNQ9UQP3 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TNNQ9UQP3 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TNNQ9UQP3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TNNQ9UQP3 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TNNQ9UQP3 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TNNQ9UQP3 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TNNQ9UQP3 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TNNQ9UQP3 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TNNQ9UQP3 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TNNQ9UQP3 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TNNQ9UQP3 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TNNQ9UQP3 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TNNQ9UQP3 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
TNNQ9UQP3 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
TNNQ9UQP3 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
TNNQ9UQP3 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
TNNQ9UQP3 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
TNNQ9UQP3 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
TNNQ9UQP3 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TNNQ9UQP3 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TNNQ9UQP3 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TNNQ9UQP3 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TNNQ9UQP3 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TNNQ9UQP3 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TNNQ9UQP3 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TNNQ9UQP3 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TNNQ9UQP3 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TNNQ9UQP3 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TNNQ9UQP3 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TNNQ9UQP3 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TNNQ9UQP3 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TNNQ9UQP3 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TNNQ9UQP3 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TNNQ9UQP3 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
TNNQ9UQP3 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TNNQ9UQP3 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms