Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULG1

INO80, DNA helicase INO80, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80Q9ULG1 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
INO80Q9ULG1 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.08
INO80Q9ULG1 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
INO80Q9ULG1 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
INO80Q9ULG1 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
INO80Q9ULG1 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC34.26■■■■□ 3.07
INO80Q9ULG1 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
INO80Q9ULG1 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
INO80Q9ULG1 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
INO80Q9ULG1 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
INO80Q9ULG1 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
INO80Q9ULG1 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
INO80Q9ULG1 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
INO80Q9ULG1 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
INO80Q9ULG1 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
INO80Q9ULG1 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
INO80Q9ULG1 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
INO80Q9ULG1 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
INO80Q9ULG1 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
INO80Q9ULG1 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
INO80Q9ULG1 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
INO80Q9ULG1 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
INO80Q9ULG1 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
INO80Q9ULG1 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
INO80Q9ULG1 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
INO80Q9ULG1 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
INO80Q9ULG1 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
INO80Q9ULG1 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
INO80Q9ULG1 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC34.22■■■■□ 3.07
INO80Q9ULG1 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
INO80Q9ULG1 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
INO80Q9ULG1 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC34.22■■■■□ 3.07
INO80Q9ULG1 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
INO80Q9ULG1 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
INO80Q9ULG1 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
INO80Q9ULG1 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
INO80Q9ULG1 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
INO80Q9ULG1 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
INO80Q9ULG1 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
INO80Q9ULG1 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC34.2■■■■□ 3.07
INO80Q9ULG1 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC34.2■■■■□ 3.07
INO80Q9ULG1 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC34.2■■■■□ 3.07
INO80Q9ULG1 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC34.2■■■■□ 3.07
INO80Q9ULG1 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
INO80Q9ULG1 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
INO80Q9ULG1 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
INO80Q9ULG1 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
INO80Q9ULG1 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
INO80Q9ULG1 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
INO80Q9ULG1 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
INO80Q9ULG1 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
INO80Q9ULG1 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
INO80Q9ULG1 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
INO80Q9ULG1 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
INO80Q9ULG1 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
INO80Q9ULG1 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
INO80Q9ULG1 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
INO80Q9ULG1 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
INO80Q9ULG1 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
INO80Q9ULG1 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
INO80Q9ULG1 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
INO80Q9ULG1 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
INO80Q9ULG1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
INO80Q9ULG1 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
INO80Q9ULG1 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
INO80Q9ULG1 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC34.16■■■■□ 3.06
INO80Q9ULG1 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
INO80Q9ULG1 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
INO80Q9ULG1 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
INO80Q9ULG1 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
INO80Q9ULG1 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
INO80Q9ULG1 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC34.15■■■■□ 3.06
INO80Q9ULG1 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
INO80Q9ULG1 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
INO80Q9ULG1 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
INO80Q9ULG1 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
INO80Q9ULG1 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
INO80Q9ULG1 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
INO80Q9ULG1 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
INO80Q9ULG1 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.14■■■■□ 3.06
INO80Q9ULG1 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
INO80Q9ULG1 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
INO80Q9ULG1 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
INO80Q9ULG1 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC34.13■■■■□ 3.05
INO80Q9ULG1 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
INO80Q9ULG1 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
INO80Q9ULG1 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
INO80Q9ULG1 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
INO80Q9ULG1 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
INO80Q9ULG1 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
INO80Q9ULG1 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
INO80Q9ULG1 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
INO80Q9ULG1 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
INO80Q9ULG1 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC34.11■■■■□ 3.05
INO80Q9ULG1 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
INO80Q9ULG1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
INO80Q9ULG1 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
INO80Q9ULG1 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
INO80Q9ULG1 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
INO80Q9ULG1 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms