Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS7

Cacna1f, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1F, mousemouse

Predictions only

Length 1,985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1fQ9JIS7 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cacna1fQ9JIS7 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Cacna1fQ9JIS7 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cacna1fQ9JIS7 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cacna1fQ9JIS7 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Cacna1fQ9JIS7 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cacna1fQ9JIS7 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cacna1fQ9JIS7 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cacna1fQ9JIS7 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cacna1fQ9JIS7 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cacna1fQ9JIS7 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cacna1fQ9JIS7 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cacna1fQ9JIS7 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cacna1fQ9JIS7 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cacna1fQ9JIS7 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cacna1fQ9JIS7 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cacna1fQ9JIS7 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cacna1fQ9JIS7 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cacna1fQ9JIS7 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cacna1fQ9JIS7 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cacna1fQ9JIS7 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cacna1fQ9JIS7 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cacna1fQ9JIS7 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cacna1fQ9JIS7 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Cacna1fQ9JIS7 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cacna1fQ9JIS7 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cacna1fQ9JIS7 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cacna1fQ9JIS7 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cacna1fQ9JIS7 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cacna1fQ9JIS7 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cacna1fQ9JIS7 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cacna1fQ9JIS7 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cacna1fQ9JIS7 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cacna1fQ9JIS7 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cacna1fQ9JIS7 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cacna1fQ9JIS7 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Cacna1fQ9JIS7 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cacna1fQ9JIS7 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cacna1fQ9JIS7 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cacna1fQ9JIS7 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cacna1fQ9JIS7 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cacna1fQ9JIS7 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cacna1fQ9JIS7 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cacna1fQ9JIS7 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cacna1fQ9JIS7 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cacna1fQ9JIS7 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Cacna1fQ9JIS7 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cacna1fQ9JIS7 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cacna1fQ9JIS7 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cacna1fQ9JIS7 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cacna1fQ9JIS7 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cacna1fQ9JIS7 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cacna1fQ9JIS7 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cacna1fQ9JIS7 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cacna1fQ9JIS7 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cacna1fQ9JIS7 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cacna1fQ9JIS7 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cacna1fQ9JIS7 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cacna1fQ9JIS7 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cacna1fQ9JIS7 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cacna1fQ9JIS7 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cacna1fQ9JIS7 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cacna1fQ9JIS7 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cacna1fQ9JIS7 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cacna1fQ9JIS7 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cacna1fQ9JIS7 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cacna1fQ9JIS7 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cacna1fQ9JIS7 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cacna1fQ9JIS7 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cacna1fQ9JIS7 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cacna1fQ9JIS7 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cacna1fQ9JIS7 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cacna1fQ9JIS7 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cacna1fQ9JIS7 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cacna1fQ9JIS7 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cacna1fQ9JIS7 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cacna1fQ9JIS7 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cacna1fQ9JIS7 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cacna1fQ9JIS7 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cacna1fQ9JIS7 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cacna1fQ9JIS7 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cacna1fQ9JIS7 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cacna1fQ9JIS7 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cacna1fQ9JIS7 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cacna1fQ9JIS7 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Cacna1fQ9JIS7 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cacna1fQ9JIS7 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cacna1fQ9JIS7 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Cacna1fQ9JIS7 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
Cacna1fQ9JIS7 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Cacna1fQ9JIS7 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cacna1fQ9JIS7 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cacna1fQ9JIS7 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cacna1fQ9JIS7 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cacna1fQ9JIS7 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cacna1fQ9JIS7 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cacna1fQ9JIS7 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cacna1fQ9JIS7 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cacna1fQ9JIS7 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cacna1fQ9JIS7 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 115 ms