Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTX3

TMEM208, Transmembrane protein 208, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM208Q9BTX3 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TMEM208Q9BTX3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TMEM208Q9BTX3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TMEM208Q9BTX3 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMEM208Q9BTX3 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMEM208Q9BTX3 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMEM208Q9BTX3 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMEM208Q9BTX3 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMEM208Q9BTX3 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMEM208Q9BTX3 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMEM208Q9BTX3 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMEM208Q9BTX3 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMEM208Q9BTX3 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMEM208Q9BTX3 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM208Q9BTX3 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM208Q9BTX3 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM208Q9BTX3 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM208Q9BTX3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM208Q9BTX3 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM208Q9BTX3 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM208Q9BTX3 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM208Q9BTX3 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM208Q9BTX3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM208Q9BTX3 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM208Q9BTX3 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM208Q9BTX3 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM208Q9BTX3 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM208Q9BTX3 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM208Q9BTX3 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM208Q9BTX3 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM208Q9BTX3 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM208Q9BTX3 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM208Q9BTX3 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM208Q9BTX3 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM208Q9BTX3 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM208Q9BTX3 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM208Q9BTX3 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM208Q9BTX3 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM208Q9BTX3 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM208Q9BTX3 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM208Q9BTX3 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM208Q9BTX3 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM208Q9BTX3 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM208Q9BTX3 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM208Q9BTX3 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM208Q9BTX3 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM208Q9BTX3 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM208Q9BTX3 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM208Q9BTX3 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM208Q9BTX3 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM208Q9BTX3 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM208Q9BTX3 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM208Q9BTX3 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM208Q9BTX3 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM208Q9BTX3 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM208Q9BTX3 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM208Q9BTX3 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM208Q9BTX3 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM208Q9BTX3 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM208Q9BTX3 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMEM208Q9BTX3 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMEM208Q9BTX3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMEM208Q9BTX3 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMEM208Q9BTX3 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMEM208Q9BTX3 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMEM208Q9BTX3 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TMEM208Q9BTX3 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMEM208Q9BTX3 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TMEM208Q9BTX3 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TMEM208Q9BTX3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMEM208Q9BTX3 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMEM208Q9BTX3 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMEM208Q9BTX3 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMEM208Q9BTX3 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMEM208Q9BTX3 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMEM208Q9BTX3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMEM208Q9BTX3 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TMEM208Q9BTX3 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMEM208Q9BTX3 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMEM208Q9BTX3 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMEM208Q9BTX3 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMEM208Q9BTX3 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMEM208Q9BTX3 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMEM208Q9BTX3 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMEM208Q9BTX3 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMEM208Q9BTX3 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMEM208Q9BTX3 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMEM208Q9BTX3 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMEM208Q9BTX3 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMEM208Q9BTX3 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMEM208Q9BTX3 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMEM208Q9BTX3 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMEM208Q9BTX3 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMEM208Q9BTX3 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMEM208Q9BTX3 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMEM208Q9BTX3 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMEM208Q9BTX3 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMEM208Q9BTX3 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TMEM208Q9BTX3 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TMEM208Q9BTX3 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms