Protein–RNA interactions for Protein: Q96MR6

CFAP57, Cilia- and flagella-associated protein 57, humanhuman

Predictions only

Length 1,250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP57Q96MR6 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CFAP57Q96MR6 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CFAP57Q96MR6 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CFAP57Q96MR6 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CFAP57Q96MR6 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CFAP57Q96MR6 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CFAP57Q96MR6 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CFAP57Q96MR6 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CFAP57Q96MR6 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CFAP57Q96MR6 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CFAP57Q96MR6 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CFAP57Q96MR6 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CFAP57Q96MR6 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CFAP57Q96MR6 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CFAP57Q96MR6 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CFAP57Q96MR6 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CFAP57Q96MR6 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CFAP57Q96MR6 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CFAP57Q96MR6 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CFAP57Q96MR6 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CFAP57Q96MR6 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CFAP57Q96MR6 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CFAP57Q96MR6 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CFAP57Q96MR6 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CFAP57Q96MR6 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CFAP57Q96MR6 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CFAP57Q96MR6 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CFAP57Q96MR6 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CFAP57Q96MR6 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CFAP57Q96MR6 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CFAP57Q96MR6 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CFAP57Q96MR6 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CFAP57Q96MR6 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CFAP57Q96MR6 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CFAP57Q96MR6 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CFAP57Q96MR6 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CFAP57Q96MR6 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CFAP57Q96MR6 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CFAP57Q96MR6 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CFAP57Q96MR6 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CFAP57Q96MR6 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CFAP57Q96MR6 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CFAP57Q96MR6 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CFAP57Q96MR6 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CFAP57Q96MR6 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CFAP57Q96MR6 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CFAP57Q96MR6 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CFAP57Q96MR6 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CFAP57Q96MR6 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CFAP57Q96MR6 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CFAP57Q96MR6 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CFAP57Q96MR6 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CFAP57Q96MR6 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CFAP57Q96MR6 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CFAP57Q96MR6 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CFAP57Q96MR6 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CFAP57Q96MR6 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CFAP57Q96MR6 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CFAP57Q96MR6 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CFAP57Q96MR6 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CFAP57Q96MR6 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CFAP57Q96MR6 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CFAP57Q96MR6 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CFAP57Q96MR6 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CFAP57Q96MR6 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CFAP57Q96MR6 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CFAP57Q96MR6 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CFAP57Q96MR6 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CFAP57Q96MR6 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CFAP57Q96MR6 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CFAP57Q96MR6 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CFAP57Q96MR6 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CFAP57Q96MR6 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CFAP57Q96MR6 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CFAP57Q96MR6 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CFAP57Q96MR6 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CFAP57Q96MR6 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CFAP57Q96MR6 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CFAP57Q96MR6 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CFAP57Q96MR6 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CFAP57Q96MR6 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CFAP57Q96MR6 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CFAP57Q96MR6 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CFAP57Q96MR6 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CFAP57Q96MR6 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CFAP57Q96MR6 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CFAP57Q96MR6 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CFAP57Q96MR6 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CFAP57Q96MR6 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CFAP57Q96MR6 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CFAP57Q96MR6 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CFAP57Q96MR6 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CFAP57Q96MR6 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CFAP57Q96MR6 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CFAP57Q96MR6 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CFAP57Q96MR6 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CFAP57Q96MR6 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CFAP57Q96MR6 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CFAP57Q96MR6 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CFAP57Q96MR6 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms