Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZW8

TNS4, Tensin-4, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS4Q8IZW8 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TNS4Q8IZW8 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TNS4Q8IZW8 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TNS4Q8IZW8 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TNS4Q8IZW8 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TNS4Q8IZW8 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TNS4Q8IZW8 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TNS4Q8IZW8 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TNS4Q8IZW8 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TNS4Q8IZW8 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TNS4Q8IZW8 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TNS4Q8IZW8 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TNS4Q8IZW8 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TNS4Q8IZW8 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TNS4Q8IZW8 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TNS4Q8IZW8 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
TNS4Q8IZW8 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TNS4Q8IZW8 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TNS4Q8IZW8 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TNS4Q8IZW8 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TNS4Q8IZW8 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TNS4Q8IZW8 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TNS4Q8IZW8 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TNS4Q8IZW8 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TNS4Q8IZW8 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TNS4Q8IZW8 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TNS4Q8IZW8 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TNS4Q8IZW8 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
TNS4Q8IZW8 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TNS4Q8IZW8 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TNS4Q8IZW8 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TNS4Q8IZW8 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TNS4Q8IZW8 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TNS4Q8IZW8 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TNS4Q8IZW8 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TNS4Q8IZW8 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TNS4Q8IZW8 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TNS4Q8IZW8 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TNS4Q8IZW8 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
TNS4Q8IZW8 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TNS4Q8IZW8 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TNS4Q8IZW8 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TNS4Q8IZW8 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TNS4Q8IZW8 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TNS4Q8IZW8 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
TNS4Q8IZW8 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TNS4Q8IZW8 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TNS4Q8IZW8 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TNS4Q8IZW8 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TNS4Q8IZW8 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TNS4Q8IZW8 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TNS4Q8IZW8 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TNS4Q8IZW8 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TNS4Q8IZW8 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TNS4Q8IZW8 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TNS4Q8IZW8 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TNS4Q8IZW8 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TNS4Q8IZW8 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TNS4Q8IZW8 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TNS4Q8IZW8 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TNS4Q8IZW8 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
TNS4Q8IZW8 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TNS4Q8IZW8 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TNS4Q8IZW8 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
TNS4Q8IZW8 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TNS4Q8IZW8 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
TNS4Q8IZW8 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TNS4Q8IZW8 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TNS4Q8IZW8 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TNS4Q8IZW8 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TNS4Q8IZW8 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TNS4Q8IZW8 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TNS4Q8IZW8 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TNS4Q8IZW8 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TNS4Q8IZW8 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TNS4Q8IZW8 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TNS4Q8IZW8 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TNS4Q8IZW8 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TNS4Q8IZW8 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
TNS4Q8IZW8 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TNS4Q8IZW8 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TNS4Q8IZW8 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TNS4Q8IZW8 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TNS4Q8IZW8 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TNS4Q8IZW8 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
TNS4Q8IZW8 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TNS4Q8IZW8 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TNS4Q8IZW8 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TNS4Q8IZW8 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TNS4Q8IZW8 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TNS4Q8IZW8 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TNS4Q8IZW8 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TNS4Q8IZW8 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TNS4Q8IZW8 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TNS4Q8IZW8 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TNS4Q8IZW8 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TNS4Q8IZW8 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TNS4Q8IZW8 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TNS4Q8IZW8 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TNS4Q8IZW8 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms