Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS6

OTOP2, Otopetrin-2, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP2Q7RTS6 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
OTOP2Q7RTS6 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
OTOP2Q7RTS6 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
OTOP2Q7RTS6 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
OTOP2Q7RTS6 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
OTOP2Q7RTS6 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
OTOP2Q7RTS6 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
OTOP2Q7RTS6 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
OTOP2Q7RTS6 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
OTOP2Q7RTS6 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
OTOP2Q7RTS6 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
OTOP2Q7RTS6 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
OTOP2Q7RTS6 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
OTOP2Q7RTS6 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
OTOP2Q7RTS6 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
OTOP2Q7RTS6 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
OTOP2Q7RTS6 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
OTOP2Q7RTS6 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
OTOP2Q7RTS6 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
OTOP2Q7RTS6 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
OTOP2Q7RTS6 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
OTOP2Q7RTS6 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
OTOP2Q7RTS6 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
OTOP2Q7RTS6 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
OTOP2Q7RTS6 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
OTOP2Q7RTS6 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
OTOP2Q7RTS6 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
OTOP2Q7RTS6 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
OTOP2Q7RTS6 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
OTOP2Q7RTS6 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
OTOP2Q7RTS6 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
OTOP2Q7RTS6 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
OTOP2Q7RTS6 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
OTOP2Q7RTS6 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
OTOP2Q7RTS6 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
OTOP2Q7RTS6 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
OTOP2Q7RTS6 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
OTOP2Q7RTS6 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
OTOP2Q7RTS6 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
OTOP2Q7RTS6 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
OTOP2Q7RTS6 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
OTOP2Q7RTS6 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
OTOP2Q7RTS6 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
OTOP2Q7RTS6 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
OTOP2Q7RTS6 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
OTOP2Q7RTS6 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
OTOP2Q7RTS6 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
OTOP2Q7RTS6 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
OTOP2Q7RTS6 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
OTOP2Q7RTS6 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
OTOP2Q7RTS6 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
OTOP2Q7RTS6 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
OTOP2Q7RTS6 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
OTOP2Q7RTS6 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
OTOP2Q7RTS6 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
OTOP2Q7RTS6 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
OTOP2Q7RTS6 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
OTOP2Q7RTS6 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
OTOP2Q7RTS6 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
OTOP2Q7RTS6 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
OTOP2Q7RTS6 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
OTOP2Q7RTS6 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
OTOP2Q7RTS6 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
OTOP2Q7RTS6 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
OTOP2Q7RTS6 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
OTOP2Q7RTS6 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
OTOP2Q7RTS6 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
OTOP2Q7RTS6 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
OTOP2Q7RTS6 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
OTOP2Q7RTS6 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
OTOP2Q7RTS6 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
OTOP2Q7RTS6 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
OTOP2Q7RTS6 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
OTOP2Q7RTS6 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
OTOP2Q7RTS6 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
OTOP2Q7RTS6 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
OTOP2Q7RTS6 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
OTOP2Q7RTS6 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
OTOP2Q7RTS6 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
OTOP2Q7RTS6 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
OTOP2Q7RTS6 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
OTOP2Q7RTS6 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
OTOP2Q7RTS6 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
OTOP2Q7RTS6 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
OTOP2Q7RTS6 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
OTOP2Q7RTS6 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
OTOP2Q7RTS6 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
OTOP2Q7RTS6 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
OTOP2Q7RTS6 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
OTOP2Q7RTS6 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
OTOP2Q7RTS6 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
OTOP2Q7RTS6 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
OTOP2Q7RTS6 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
OTOP2Q7RTS6 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
OTOP2Q7RTS6 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
OTOP2Q7RTS6 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
OTOP2Q7RTS6 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
OTOP2Q7RTS6 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
OTOP2Q7RTS6 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
OTOP2Q7RTS6 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms