Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS5

OTOP3, Otopetrin-3, humanhuman

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP3Q7RTS5 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
OTOP3Q7RTS5 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
OTOP3Q7RTS5 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
OTOP3Q7RTS5 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
OTOP3Q7RTS5 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
OTOP3Q7RTS5 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
OTOP3Q7RTS5 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
OTOP3Q7RTS5 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
OTOP3Q7RTS5 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
OTOP3Q7RTS5 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
OTOP3Q7RTS5 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
OTOP3Q7RTS5 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
OTOP3Q7RTS5 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
OTOP3Q7RTS5 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
OTOP3Q7RTS5 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
OTOP3Q7RTS5 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
OTOP3Q7RTS5 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
OTOP3Q7RTS5 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
OTOP3Q7RTS5 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
OTOP3Q7RTS5 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
OTOP3Q7RTS5 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
OTOP3Q7RTS5 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
OTOP3Q7RTS5 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
OTOP3Q7RTS5 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
OTOP3Q7RTS5 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
OTOP3Q7RTS5 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
OTOP3Q7RTS5 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
OTOP3Q7RTS5 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
OTOP3Q7RTS5 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
OTOP3Q7RTS5 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
OTOP3Q7RTS5 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
OTOP3Q7RTS5 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
OTOP3Q7RTS5 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
OTOP3Q7RTS5 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
OTOP3Q7RTS5 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
OTOP3Q7RTS5 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
OTOP3Q7RTS5 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
OTOP3Q7RTS5 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
OTOP3Q7RTS5 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
OTOP3Q7RTS5 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
OTOP3Q7RTS5 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
OTOP3Q7RTS5 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
OTOP3Q7RTS5 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
OTOP3Q7RTS5 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
OTOP3Q7RTS5 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
OTOP3Q7RTS5 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
OTOP3Q7RTS5 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
OTOP3Q7RTS5 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
OTOP3Q7RTS5 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
OTOP3Q7RTS5 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
OTOP3Q7RTS5 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
OTOP3Q7RTS5 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
OTOP3Q7RTS5 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
OTOP3Q7RTS5 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
OTOP3Q7RTS5 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
OTOP3Q7RTS5 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
OTOP3Q7RTS5 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
OTOP3Q7RTS5 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
OTOP3Q7RTS5 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
OTOP3Q7RTS5 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
OTOP3Q7RTS5 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
OTOP3Q7RTS5 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
OTOP3Q7RTS5 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
OTOP3Q7RTS5 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
OTOP3Q7RTS5 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
OTOP3Q7RTS5 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
OTOP3Q7RTS5 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
OTOP3Q7RTS5 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
OTOP3Q7RTS5 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
OTOP3Q7RTS5 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
OTOP3Q7RTS5 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
OTOP3Q7RTS5 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
OTOP3Q7RTS5 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
OTOP3Q7RTS5 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
OTOP3Q7RTS5 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
OTOP3Q7RTS5 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
OTOP3Q7RTS5 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
OTOP3Q7RTS5 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
OTOP3Q7RTS5 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
OTOP3Q7RTS5 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
OTOP3Q7RTS5 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
OTOP3Q7RTS5 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
OTOP3Q7RTS5 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
OTOP3Q7RTS5 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
OTOP3Q7RTS5 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
OTOP3Q7RTS5 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
OTOP3Q7RTS5 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
OTOP3Q7RTS5 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
OTOP3Q7RTS5 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
OTOP3Q7RTS5 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
OTOP3Q7RTS5 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
OTOP3Q7RTS5 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
OTOP3Q7RTS5 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
OTOP3Q7RTS5 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
OTOP3Q7RTS5 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
OTOP3Q7RTS5 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
OTOP3Q7RTS5 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
OTOP3Q7RTS5 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
OTOP3Q7RTS5 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
OTOP3Q7RTS5 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.2 ms