Protein–RNA interactions for Protein: Q6S5G4

Gja6, Gap junction alpha-6 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja6Q6S5G4 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gja6Q6S5G4 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gja6Q6S5G4 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gja6Q6S5G4 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gja6Q6S5G4 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gja6Q6S5G4 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gja6Q6S5G4 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Gja6Q6S5G4 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Gja6Q6S5G4 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gja6Q6S5G4 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gja6Q6S5G4 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gja6Q6S5G4 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gja6Q6S5G4 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gja6Q6S5G4 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gja6Q6S5G4 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gja6Q6S5G4 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gja6Q6S5G4 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Gja6Q6S5G4 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gja6Q6S5G4 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gja6Q6S5G4 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gja6Q6S5G4 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gja6Q6S5G4 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gja6Q6S5G4 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gja6Q6S5G4 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gja6Q6S5G4 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gja6Q6S5G4 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gja6Q6S5G4 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gja6Q6S5G4 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gja6Q6S5G4 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gja6Q6S5G4 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gja6Q6S5G4 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gja6Q6S5G4 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gja6Q6S5G4 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gja6Q6S5G4 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gja6Q6S5G4 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gja6Q6S5G4 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gja6Q6S5G4 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gja6Q6S5G4 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Gja6Q6S5G4 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gja6Q6S5G4 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gja6Q6S5G4 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gja6Q6S5G4 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gja6Q6S5G4 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Gja6Q6S5G4 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gja6Q6S5G4 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gja6Q6S5G4 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gja6Q6S5G4 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gja6Q6S5G4 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gja6Q6S5G4 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gja6Q6S5G4 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Gja6Q6S5G4 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gja6Q6S5G4 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Gja6Q6S5G4 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gja6Q6S5G4 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Gja6Q6S5G4 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Gja6Q6S5G4 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Gja6Q6S5G4 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gja6Q6S5G4 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gja6Q6S5G4 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gja6Q6S5G4 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gja6Q6S5G4 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gja6Q6S5G4 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gja6Q6S5G4 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gja6Q6S5G4 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gja6Q6S5G4 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gja6Q6S5G4 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gja6Q6S5G4 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gja6Q6S5G4 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gja6Q6S5G4 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gja6Q6S5G4 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gja6Q6S5G4 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gja6Q6S5G4 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gja6Q6S5G4 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gja6Q6S5G4 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gja6Q6S5G4 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gja6Q6S5G4 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gja6Q6S5G4 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gja6Q6S5G4 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gja6Q6S5G4 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gja6Q6S5G4 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gja6Q6S5G4 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gja6Q6S5G4 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gja6Q6S5G4 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gja6Q6S5G4 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gja6Q6S5G4 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gja6Q6S5G4 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gja6Q6S5G4 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gja6Q6S5G4 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gja6Q6S5G4 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gja6Q6S5G4 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gja6Q6S5G4 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gja6Q6S5G4 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gja6Q6S5G4 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gja6Q6S5G4 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gja6Q6S5G4 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gja6Q6S5G4 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gja6Q6S5G4 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gja6Q6S5G4 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gja6Q6S5G4 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gja6Q6S5G4 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms