Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 1,325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
ZBED9Q6R2W3 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
ZBED9Q6R2W3 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
ZBED9Q6R2W3 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
ZBED9Q6R2W3 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
ZBED9Q6R2W3 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
ZBED9Q6R2W3 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
ZBED9Q6R2W3 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
ZBED9Q6R2W3 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
ZBED9Q6R2W3 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
ZBED9Q6R2W3 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
ZBED9Q6R2W3 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
ZBED9Q6R2W3 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
ZBED9Q6R2W3 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
ZBED9Q6R2W3 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
ZBED9Q6R2W3 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
ZBED9Q6R2W3 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
ZBED9Q6R2W3 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
ZBED9Q6R2W3 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
ZBED9Q6R2W3 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC30.05■■■□□ 2.4
ZBED9Q6R2W3 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
ZBED9Q6R2W3 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
ZBED9Q6R2W3 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
ZBED9Q6R2W3 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
ZBED9Q6R2W3 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
ZBED9Q6R2W3 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
ZBED9Q6R2W3 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
ZBED9Q6R2W3 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
ZBED9Q6R2W3 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
ZBED9Q6R2W3 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
ZBED9Q6R2W3 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
ZBED9Q6R2W3 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
ZBED9Q6R2W3 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
ZBED9Q6R2W3 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
ZBED9Q6R2W3 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
ZBED9Q6R2W3 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
ZBED9Q6R2W3 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
ZBED9Q6R2W3 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
ZBED9Q6R2W3 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC30.03■■■□□ 2.4
ZBED9Q6R2W3 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
ZBED9Q6R2W3 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
ZBED9Q6R2W3 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
ZBED9Q6R2W3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
ZBED9Q6R2W3 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
ZBED9Q6R2W3 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
ZBED9Q6R2W3 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
ZBED9Q6R2W3 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
ZBED9Q6R2W3 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.4
ZBED9Q6R2W3 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
ZBED9Q6R2W3 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
ZBED9Q6R2W3 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
ZBED9Q6R2W3 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
ZBED9Q6R2W3 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
ZBED9Q6R2W3 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
ZBED9Q6R2W3 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
ZBED9Q6R2W3 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
ZBED9Q6R2W3 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
ZBED9Q6R2W3 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
ZBED9Q6R2W3 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
ZBED9Q6R2W3 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
ZBED9Q6R2W3 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
ZBED9Q6R2W3 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
ZBED9Q6R2W3 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC30■■■□□ 2.39
ZBED9Q6R2W3 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
ZBED9Q6R2W3 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
ZBED9Q6R2W3 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
ZBED9Q6R2W3 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC29.99■■■□□ 2.39
ZBED9Q6R2W3 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
ZBED9Q6R2W3 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
ZBED9Q6R2W3 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
ZBED9Q6R2W3 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC29.98■■■□□ 2.39
ZBED9Q6R2W3 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
ZBED9Q6R2W3 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
ZBED9Q6R2W3 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
ZBED9Q6R2W3 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
ZBED9Q6R2W3 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
ZBED9Q6R2W3 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
ZBED9Q6R2W3 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
ZBED9Q6R2W3 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
ZBED9Q6R2W3 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
ZBED9Q6R2W3 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
ZBED9Q6R2W3 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
ZBED9Q6R2W3 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC29.97■■■□□ 2.39
ZBED9Q6R2W3 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
ZBED9Q6R2W3 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
ZBED9Q6R2W3 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
ZBED9Q6R2W3 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
ZBED9Q6R2W3 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
ZBED9Q6R2W3 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
ZBED9Q6R2W3 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
ZBED9Q6R2W3 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
ZBED9Q6R2W3 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
ZBED9Q6R2W3 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
ZBED9Q6R2W3 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
ZBED9Q6R2W3 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC29.96■■■□□ 2.39
ZBED9Q6R2W3 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC29.96■■■□□ 2.39
ZBED9Q6R2W3 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
ZBED9Q6R2W3 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
ZBED9Q6R2W3 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
ZBED9Q6R2W3 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
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