Protein–RNA interactions for Protein: Q5TF21

SOGA3, Protein SOGA3, humanhuman

Predictions only

Length 947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOGA3Q5TF21 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SOGA3Q5TF21 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SOGA3Q5TF21 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SOGA3Q5TF21 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SOGA3Q5TF21 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SOGA3Q5TF21 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SOGA3Q5TF21 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SOGA3Q5TF21 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SOGA3Q5TF21 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SOGA3Q5TF21 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SOGA3Q5TF21 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SOGA3Q5TF21 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SOGA3Q5TF21 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SOGA3Q5TF21 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SOGA3Q5TF21 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SOGA3Q5TF21 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SOGA3Q5TF21 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SOGA3Q5TF21 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SOGA3Q5TF21 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SOGA3Q5TF21 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SOGA3Q5TF21 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SOGA3Q5TF21 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
SOGA3Q5TF21 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
SOGA3Q5TF21 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
SOGA3Q5TF21 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
SOGA3Q5TF21 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SOGA3Q5TF21 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SOGA3Q5TF21 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SOGA3Q5TF21 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SOGA3Q5TF21 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SOGA3Q5TF21 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SOGA3Q5TF21 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SOGA3Q5TF21 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SOGA3Q5TF21 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SOGA3Q5TF21 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SOGA3Q5TF21 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SOGA3Q5TF21 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SOGA3Q5TF21 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SOGA3Q5TF21 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SOGA3Q5TF21 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SOGA3Q5TF21 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SOGA3Q5TF21 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SOGA3Q5TF21 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
SOGA3Q5TF21 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SOGA3Q5TF21 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SOGA3Q5TF21 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SOGA3Q5TF21 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SOGA3Q5TF21 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SOGA3Q5TF21 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SOGA3Q5TF21 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
SOGA3Q5TF21 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SOGA3Q5TF21 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
SOGA3Q5TF21 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SOGA3Q5TF21 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SOGA3Q5TF21 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SOGA3Q5TF21 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SOGA3Q5TF21 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SOGA3Q5TF21 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SOGA3Q5TF21 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SOGA3Q5TF21 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SOGA3Q5TF21 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SOGA3Q5TF21 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SOGA3Q5TF21 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
SOGA3Q5TF21 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SOGA3Q5TF21 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SOGA3Q5TF21 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SOGA3Q5TF21 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SOGA3Q5TF21 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SOGA3Q5TF21 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SOGA3Q5TF21 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
SOGA3Q5TF21 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SOGA3Q5TF21 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SOGA3Q5TF21 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SOGA3Q5TF21 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
SOGA3Q5TF21 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
SOGA3Q5TF21 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SOGA3Q5TF21 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28■■■□□ 2.07
SOGA3Q5TF21 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SOGA3Q5TF21 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SOGA3Q5TF21 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SOGA3Q5TF21 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SOGA3Q5TF21 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SOGA3Q5TF21 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SOGA3Q5TF21 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SOGA3Q5TF21 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
SOGA3Q5TF21 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SOGA3Q5TF21 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SOGA3Q5TF21 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SOGA3Q5TF21 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SOGA3Q5TF21 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SOGA3Q5TF21 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SOGA3Q5TF21 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
SOGA3Q5TF21 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SOGA3Q5TF21 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SOGA3Q5TF21 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SOGA3Q5TF21 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SOGA3Q5TF21 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SOGA3Q5TF21 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SOGA3Q5TF21 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SOGA3Q5TF21 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms