Protein–RNA interactions for Protein: Q5QGT7

RTP2, Receptor-transporting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTP2Q5QGT7 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RTP2Q5QGT7 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RTP2Q5QGT7 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RTP2Q5QGT7 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RTP2Q5QGT7 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RTP2Q5QGT7 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RTP2Q5QGT7 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RTP2Q5QGT7 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
RTP2Q5QGT7 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
RTP2Q5QGT7 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RTP2Q5QGT7 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RTP2Q5QGT7 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RTP2Q5QGT7 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RTP2Q5QGT7 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RTP2Q5QGT7 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RTP2Q5QGT7 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
RTP2Q5QGT7 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
RTP2Q5QGT7 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RTP2Q5QGT7 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RTP2Q5QGT7 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RTP2Q5QGT7 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
RTP2Q5QGT7 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RTP2Q5QGT7 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RTP2Q5QGT7 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
RTP2Q5QGT7 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RTP2Q5QGT7 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RTP2Q5QGT7 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RTP2Q5QGT7 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RTP2Q5QGT7 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RTP2Q5QGT7 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
RTP2Q5QGT7 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
RTP2Q5QGT7 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
RTP2Q5QGT7 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RTP2Q5QGT7 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RTP2Q5QGT7 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RTP2Q5QGT7 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RTP2Q5QGT7 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RTP2Q5QGT7 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RTP2Q5QGT7 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RTP2Q5QGT7 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RTP2Q5QGT7 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RTP2Q5QGT7 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RTP2Q5QGT7 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RTP2Q5QGT7 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RTP2Q5QGT7 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RTP2Q5QGT7 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RTP2Q5QGT7 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RTP2Q5QGT7 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RTP2Q5QGT7 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RTP2Q5QGT7 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RTP2Q5QGT7 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RTP2Q5QGT7 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RTP2Q5QGT7 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RTP2Q5QGT7 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RTP2Q5QGT7 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
RTP2Q5QGT7 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RTP2Q5QGT7 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RTP2Q5QGT7 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RTP2Q5QGT7 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RTP2Q5QGT7 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RTP2Q5QGT7 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RTP2Q5QGT7 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RTP2Q5QGT7 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RTP2Q5QGT7 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RTP2Q5QGT7 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
RTP2Q5QGT7 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RTP2Q5QGT7 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RTP2Q5QGT7 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RTP2Q5QGT7 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RTP2Q5QGT7 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RTP2Q5QGT7 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RTP2Q5QGT7 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RTP2Q5QGT7 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RTP2Q5QGT7 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RTP2Q5QGT7 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RTP2Q5QGT7 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RTP2Q5QGT7 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RTP2Q5QGT7 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RTP2Q5QGT7 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RTP2Q5QGT7 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RTP2Q5QGT7 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RTP2Q5QGT7 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RTP2Q5QGT7 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RTP2Q5QGT7 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RTP2Q5QGT7 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RTP2Q5QGT7 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RTP2Q5QGT7 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RTP2Q5QGT7 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
RTP2Q5QGT7 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RTP2Q5QGT7 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RTP2Q5QGT7 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RTP2Q5QGT7 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RTP2Q5QGT7 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RTP2Q5QGT7 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RTP2Q5QGT7 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RTP2Q5QGT7 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RTP2Q5QGT7 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RTP2Q5QGT7 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RTP2Q5QGT7 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
RTP2Q5QGT7 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms