Protein–RNA interactions for Protein: Q53SF7

COBLL1, Cordon-bleu protein-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COBLL1Q53SF7 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
COBLL1Q53SF7 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
COBLL1Q53SF7 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
COBLL1Q53SF7 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
COBLL1Q53SF7 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
COBLL1Q53SF7 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
COBLL1Q53SF7 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
COBLL1Q53SF7 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
COBLL1Q53SF7 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
COBLL1Q53SF7 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
COBLL1Q53SF7 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
COBLL1Q53SF7 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
COBLL1Q53SF7 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
COBLL1Q53SF7 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
COBLL1Q53SF7 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
COBLL1Q53SF7 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
COBLL1Q53SF7 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
COBLL1Q53SF7 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
COBLL1Q53SF7 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
COBLL1Q53SF7 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
COBLL1Q53SF7 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
COBLL1Q53SF7 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
COBLL1Q53SF7 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
COBLL1Q53SF7 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
COBLL1Q53SF7 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
COBLL1Q53SF7 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
COBLL1Q53SF7 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
COBLL1Q53SF7 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
COBLL1Q53SF7 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
COBLL1Q53SF7 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
COBLL1Q53SF7 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
COBLL1Q53SF7 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
COBLL1Q53SF7 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
COBLL1Q53SF7 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
COBLL1Q53SF7 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
COBLL1Q53SF7 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
COBLL1Q53SF7 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
COBLL1Q53SF7 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
COBLL1Q53SF7 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
COBLL1Q53SF7 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
COBLL1Q53SF7 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
COBLL1Q53SF7 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
COBLL1Q53SF7 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
COBLL1Q53SF7 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
COBLL1Q53SF7 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
COBLL1Q53SF7 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
COBLL1Q53SF7 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
COBLL1Q53SF7 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
COBLL1Q53SF7 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
COBLL1Q53SF7 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
COBLL1Q53SF7 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
COBLL1Q53SF7 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
COBLL1Q53SF7 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
COBLL1Q53SF7 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
COBLL1Q53SF7 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
COBLL1Q53SF7 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
COBLL1Q53SF7 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
COBLL1Q53SF7 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
COBLL1Q53SF7 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
COBLL1Q53SF7 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
COBLL1Q53SF7 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
COBLL1Q53SF7 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
COBLL1Q53SF7 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
COBLL1Q53SF7 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
COBLL1Q53SF7 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
COBLL1Q53SF7 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
COBLL1Q53SF7 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
COBLL1Q53SF7 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
COBLL1Q53SF7 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
COBLL1Q53SF7 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
COBLL1Q53SF7 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
COBLL1Q53SF7 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
COBLL1Q53SF7 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
COBLL1Q53SF7 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
COBLL1Q53SF7 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
COBLL1Q53SF7 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
COBLL1Q53SF7 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
COBLL1Q53SF7 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
COBLL1Q53SF7 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
COBLL1Q53SF7 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
COBLL1Q53SF7 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
COBLL1Q53SF7 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
COBLL1Q53SF7 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
COBLL1Q53SF7 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
COBLL1Q53SF7 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
COBLL1Q53SF7 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
COBLL1Q53SF7 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
COBLL1Q53SF7 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
COBLL1Q53SF7 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
COBLL1Q53SF7 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
COBLL1Q53SF7 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
COBLL1Q53SF7 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
COBLL1Q53SF7 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
COBLL1Q53SF7 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
COBLL1Q53SF7 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
COBLL1Q53SF7 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
COBLL1Q53SF7 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
COBLL1Q53SF7 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
COBLL1Q53SF7 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
COBLL1Q53SF7 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms