Protein–RNA interactions for Protein: Q3TD49

Sppl2b, Signal peptide peptidase-like 2B, mousemouse

Predictions only

Length 578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sppl2bQ3TD49 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sppl2bQ3TD49 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sppl2bQ3TD49 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sppl2bQ3TD49 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sppl2bQ3TD49 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sppl2bQ3TD49 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sppl2bQ3TD49 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sppl2bQ3TD49 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sppl2bQ3TD49 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Sppl2bQ3TD49 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sppl2bQ3TD49 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Sppl2bQ3TD49 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Sppl2bQ3TD49 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sppl2bQ3TD49 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sppl2bQ3TD49 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sppl2bQ3TD49 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sppl2bQ3TD49 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sppl2bQ3TD49 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sppl2bQ3TD49 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sppl2bQ3TD49 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sppl2bQ3TD49 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sppl2bQ3TD49 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sppl2bQ3TD49 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sppl2bQ3TD49 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sppl2bQ3TD49 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sppl2bQ3TD49 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sppl2bQ3TD49 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sppl2bQ3TD49 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sppl2bQ3TD49 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sppl2bQ3TD49 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sppl2bQ3TD49 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sppl2bQ3TD49 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sppl2bQ3TD49 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sppl2bQ3TD49 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sppl2bQ3TD49 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sppl2bQ3TD49 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sppl2bQ3TD49 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sppl2bQ3TD49 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sppl2bQ3TD49 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sppl2bQ3TD49 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sppl2bQ3TD49 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sppl2bQ3TD49 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sppl2bQ3TD49 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sppl2bQ3TD49 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sppl2bQ3TD49 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sppl2bQ3TD49 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sppl2bQ3TD49 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sppl2bQ3TD49 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sppl2bQ3TD49 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sppl2bQ3TD49 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sppl2bQ3TD49 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sppl2bQ3TD49 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sppl2bQ3TD49 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sppl2bQ3TD49 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sppl2bQ3TD49 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sppl2bQ3TD49 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sppl2bQ3TD49 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sppl2bQ3TD49 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sppl2bQ3TD49 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sppl2bQ3TD49 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Sppl2bQ3TD49 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sppl2bQ3TD49 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sppl2bQ3TD49 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sppl2bQ3TD49 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Sppl2bQ3TD49 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Sppl2bQ3TD49 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Sppl2bQ3TD49 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sppl2bQ3TD49 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sppl2bQ3TD49 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sppl2bQ3TD49 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sppl2bQ3TD49 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sppl2bQ3TD49 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sppl2bQ3TD49 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sppl2bQ3TD49 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sppl2bQ3TD49 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sppl2bQ3TD49 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sppl2bQ3TD49 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sppl2bQ3TD49 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sppl2bQ3TD49 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sppl2bQ3TD49 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sppl2bQ3TD49 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sppl2bQ3TD49 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sppl2bQ3TD49 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sppl2bQ3TD49 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sppl2bQ3TD49 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sppl2bQ3TD49 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sppl2bQ3TD49 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sppl2bQ3TD49 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sppl2bQ3TD49 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sppl2bQ3TD49 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sppl2bQ3TD49 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sppl2bQ3TD49 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sppl2bQ3TD49 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sppl2bQ3TD49 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sppl2bQ3TD49 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sppl2bQ3TD49 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sppl2bQ3TD49 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sppl2bQ3TD49 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sppl2bQ3TD49 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sppl2bQ3TD49 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms