Protein–RNA interactions for Protein: Q15120

PDK3, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK3Q15120 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDK3Q15120 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDK3Q15120 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDK3Q15120 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDK3Q15120 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDK3Q15120 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDK3Q15120 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDK3Q15120 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDK3Q15120 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDK3Q15120 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDK3Q15120 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDK3Q15120 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PDK3Q15120 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDK3Q15120 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDK3Q15120 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDK3Q15120 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDK3Q15120 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDK3Q15120 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDK3Q15120 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDK3Q15120 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDK3Q15120 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDK3Q15120 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDK3Q15120 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDK3Q15120 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDK3Q15120 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDK3Q15120 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDK3Q15120 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDK3Q15120 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDK3Q15120 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDK3Q15120 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDK3Q15120 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDK3Q15120 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDK3Q15120 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDK3Q15120 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDK3Q15120 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDK3Q15120 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDK3Q15120 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDK3Q15120 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDK3Q15120 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PDK3Q15120 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDK3Q15120 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDK3Q15120 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDK3Q15120 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PDK3Q15120 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDK3Q15120 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDK3Q15120 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDK3Q15120 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDK3Q15120 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDK3Q15120 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDK3Q15120 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDK3Q15120 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDK3Q15120 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDK3Q15120 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDK3Q15120 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDK3Q15120 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDK3Q15120 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDK3Q15120 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDK3Q15120 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDK3Q15120 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDK3Q15120 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDK3Q15120 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDK3Q15120 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDK3Q15120 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDK3Q15120 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDK3Q15120 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PDK3Q15120 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDK3Q15120 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDK3Q15120 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDK3Q15120 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDK3Q15120 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDK3Q15120 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDK3Q15120 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDK3Q15120 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDK3Q15120 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDK3Q15120 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDK3Q15120 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDK3Q15120 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDK3Q15120 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDK3Q15120 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDK3Q15120 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDK3Q15120 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDK3Q15120 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDK3Q15120 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDK3Q15120 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDK3Q15120 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDK3Q15120 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDK3Q15120 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDK3Q15120 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDK3Q15120 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDK3Q15120 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDK3Q15120 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDK3Q15120 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDK3Q15120 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDK3Q15120 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDK3Q15120 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PDK3Q15120 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PDK3Q15120 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDK3Q15120 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PDK3Q15120 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDK3Q15120 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
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