Protein–RNA interactions for Protein: Q08AF3

SLFN5, Schlafen family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 891 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN5Q08AF3 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SLFN5Q08AF3 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SLFN5Q08AF3 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SLFN5Q08AF3 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SLFN5Q08AF3 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SLFN5Q08AF3 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SLFN5Q08AF3 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SLFN5Q08AF3 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SLFN5Q08AF3 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SLFN5Q08AF3 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SLFN5Q08AF3 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SLFN5Q08AF3 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
SLFN5Q08AF3 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SLFN5Q08AF3 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SLFN5Q08AF3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SLFN5Q08AF3 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SLFN5Q08AF3 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SLFN5Q08AF3 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SLFN5Q08AF3 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SLFN5Q08AF3 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SLFN5Q08AF3 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SLFN5Q08AF3 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
SLFN5Q08AF3 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SLFN5Q08AF3 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SLFN5Q08AF3 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SLFN5Q08AF3 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SLFN5Q08AF3 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SLFN5Q08AF3 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SLFN5Q08AF3 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SLFN5Q08AF3 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
SLFN5Q08AF3 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
SLFN5Q08AF3 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC29.58■■■□□ 2.33
SLFN5Q08AF3 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SLFN5Q08AF3 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SLFN5Q08AF3 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SLFN5Q08AF3 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SLFN5Q08AF3 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SLFN5Q08AF3 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SLFN5Q08AF3 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SLFN5Q08AF3 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SLFN5Q08AF3 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SLFN5Q08AF3 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SLFN5Q08AF3 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SLFN5Q08AF3 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
SLFN5Q08AF3 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
SLFN5Q08AF3 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SLFN5Q08AF3 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SLFN5Q08AF3 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SLFN5Q08AF3 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SLFN5Q08AF3 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SLFN5Q08AF3 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SLFN5Q08AF3 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SLFN5Q08AF3 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SLFN5Q08AF3 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SLFN5Q08AF3 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SLFN5Q08AF3 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SLFN5Q08AF3 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SLFN5Q08AF3 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SLFN5Q08AF3 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SLFN5Q08AF3 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SLFN5Q08AF3 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SLFN5Q08AF3 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SLFN5Q08AF3 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SLFN5Q08AF3 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SLFN5Q08AF3 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SLFN5Q08AF3 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SLFN5Q08AF3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SLFN5Q08AF3 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SLFN5Q08AF3 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SLFN5Q08AF3 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SLFN5Q08AF3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SLFN5Q08AF3 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SLFN5Q08AF3 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SLFN5Q08AF3 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SLFN5Q08AF3 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SLFN5Q08AF3 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SLFN5Q08AF3 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SLFN5Q08AF3 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SLFN5Q08AF3 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SLFN5Q08AF3 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
SLFN5Q08AF3 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SLFN5Q08AF3 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SLFN5Q08AF3 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SLFN5Q08AF3 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SLFN5Q08AF3 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SLFN5Q08AF3 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SLFN5Q08AF3 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SLFN5Q08AF3 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SLFN5Q08AF3 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SLFN5Q08AF3 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SLFN5Q08AF3 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
SLFN5Q08AF3 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SLFN5Q08AF3 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SLFN5Q08AF3 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SLFN5Q08AF3 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
SLFN5Q08AF3 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SLFN5Q08AF3 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SLFN5Q08AF3 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
SLFN5Q08AF3 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
SLFN5Q08AF3 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms