Protein–RNA interactions for Protein: Q03591

CFHR1, Complement factor H-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFHR1Q03591 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CFHR1Q03591 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CFHR1Q03591 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CFHR1Q03591 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CFHR1Q03591 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CFHR1Q03591 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CFHR1Q03591 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CFHR1Q03591 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CFHR1Q03591 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CFHR1Q03591 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CFHR1Q03591 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CFHR1Q03591 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CFHR1Q03591 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CFHR1Q03591 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CFHR1Q03591 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CFHR1Q03591 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CFHR1Q03591 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CFHR1Q03591 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CFHR1Q03591 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CFHR1Q03591 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CFHR1Q03591 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CFHR1Q03591 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CFHR1Q03591 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CFHR1Q03591 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CFHR1Q03591 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CFHR1Q03591 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CFHR1Q03591 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CFHR1Q03591 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CFHR1Q03591 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CFHR1Q03591 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CFHR1Q03591 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CFHR1Q03591 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CFHR1Q03591 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CFHR1Q03591 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CFHR1Q03591 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CFHR1Q03591 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CFHR1Q03591 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CFHR1Q03591 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CFHR1Q03591 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CFHR1Q03591 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CFHR1Q03591 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CFHR1Q03591 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CFHR1Q03591 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CFHR1Q03591 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CFHR1Q03591 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CFHR1Q03591 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CFHR1Q03591 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CFHR1Q03591 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CFHR1Q03591 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CFHR1Q03591 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CFHR1Q03591 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CFHR1Q03591 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CFHR1Q03591 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CFHR1Q03591 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CFHR1Q03591 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CFHR1Q03591 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CFHR1Q03591 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CFHR1Q03591 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CFHR1Q03591 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CFHR1Q03591 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CFHR1Q03591 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CFHR1Q03591 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CFHR1Q03591 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CFHR1Q03591 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CFHR1Q03591 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CFHR1Q03591 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CFHR1Q03591 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CFHR1Q03591 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CFHR1Q03591 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CFHR1Q03591 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CFHR1Q03591 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CFHR1Q03591 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CFHR1Q03591 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CFHR1Q03591 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CFHR1Q03591 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CFHR1Q03591 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CFHR1Q03591 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CFHR1Q03591 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CFHR1Q03591 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CFHR1Q03591 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CFHR1Q03591 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CFHR1Q03591 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CFHR1Q03591 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CFHR1Q03591 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CFHR1Q03591 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CFHR1Q03591 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CFHR1Q03591 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CFHR1Q03591 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CFHR1Q03591 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CFHR1Q03591 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CFHR1Q03591 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CFHR1Q03591 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CFHR1Q03591 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CFHR1Q03591 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CFHR1Q03591 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CFHR1Q03591 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CFHR1Q03591 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CFHR1Q03591 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CFHR1Q03591 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CFHR1Q03591 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms