Protein–RNA interactions for Protein: Q02246

CNTN2, Contactin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN2Q02246 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CNTN2Q02246 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CNTN2Q02246 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CNTN2Q02246 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CNTN2Q02246 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CNTN2Q02246 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CNTN2Q02246 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CNTN2Q02246 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CNTN2Q02246 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CNTN2Q02246 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CNTN2Q02246 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CNTN2Q02246 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CNTN2Q02246 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CNTN2Q02246 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CNTN2Q02246 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CNTN2Q02246 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CNTN2Q02246 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CNTN2Q02246 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CNTN2Q02246 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CNTN2Q02246 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CNTN2Q02246 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CNTN2Q02246 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CNTN2Q02246 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CNTN2Q02246 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CNTN2Q02246 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CNTN2Q02246 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CNTN2Q02246 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CNTN2Q02246 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CNTN2Q02246 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CNTN2Q02246 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CNTN2Q02246 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CNTN2Q02246 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CNTN2Q02246 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CNTN2Q02246 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CNTN2Q02246 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CNTN2Q02246 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CNTN2Q02246 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CNTN2Q02246 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CNTN2Q02246 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CNTN2Q02246 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CNTN2Q02246 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CNTN2Q02246 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CNTN2Q02246 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CNTN2Q02246 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CNTN2Q02246 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CNTN2Q02246 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CNTN2Q02246 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CNTN2Q02246 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CNTN2Q02246 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CNTN2Q02246 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
CNTN2Q02246 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CNTN2Q02246 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CNTN2Q02246 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CNTN2Q02246 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CNTN2Q02246 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CNTN2Q02246 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CNTN2Q02246 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CNTN2Q02246 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CNTN2Q02246 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CNTN2Q02246 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CNTN2Q02246 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CNTN2Q02246 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CNTN2Q02246 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CNTN2Q02246 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CNTN2Q02246 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CNTN2Q02246 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CNTN2Q02246 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CNTN2Q02246 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CNTN2Q02246 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CNTN2Q02246 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CNTN2Q02246 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CNTN2Q02246 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CNTN2Q02246 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CNTN2Q02246 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CNTN2Q02246 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CNTN2Q02246 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CNTN2Q02246 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CNTN2Q02246 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CNTN2Q02246 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CNTN2Q02246 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CNTN2Q02246 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CNTN2Q02246 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CNTN2Q02246 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CNTN2Q02246 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CNTN2Q02246 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CNTN2Q02246 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CNTN2Q02246 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CNTN2Q02246 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CNTN2Q02246 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CNTN2Q02246 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CNTN2Q02246 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CNTN2Q02246 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CNTN2Q02246 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CNTN2Q02246 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CNTN2Q02246 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CNTN2Q02246 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CNTN2Q02246 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CNTN2Q02246 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CNTN2Q02246 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CNTN2Q02246 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms