Protein–RNA interactions for Protein: Q01850

CDR2, Cerebellar degeneration-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDR2Q01850 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDR2Q01850 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDR2Q01850 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDR2Q01850 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDR2Q01850 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CDR2Q01850 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDR2Q01850 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDR2Q01850 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDR2Q01850 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDR2Q01850 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDR2Q01850 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDR2Q01850 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDR2Q01850 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDR2Q01850 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDR2Q01850 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDR2Q01850 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDR2Q01850 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDR2Q01850 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDR2Q01850 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDR2Q01850 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDR2Q01850 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDR2Q01850 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDR2Q01850 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDR2Q01850 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDR2Q01850 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDR2Q01850 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDR2Q01850 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDR2Q01850 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDR2Q01850 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDR2Q01850 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDR2Q01850 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDR2Q01850 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDR2Q01850 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDR2Q01850 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDR2Q01850 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDR2Q01850 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDR2Q01850 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDR2Q01850 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CDR2Q01850 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDR2Q01850 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDR2Q01850 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDR2Q01850 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDR2Q01850 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDR2Q01850 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDR2Q01850 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDR2Q01850 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CDR2Q01850 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDR2Q01850 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CDR2Q01850 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDR2Q01850 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDR2Q01850 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDR2Q01850 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDR2Q01850 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDR2Q01850 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDR2Q01850 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDR2Q01850 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDR2Q01850 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDR2Q01850 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDR2Q01850 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDR2Q01850 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CDR2Q01850 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDR2Q01850 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDR2Q01850 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDR2Q01850 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDR2Q01850 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CDR2Q01850 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDR2Q01850 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDR2Q01850 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDR2Q01850 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDR2Q01850 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDR2Q01850 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CDR2Q01850 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDR2Q01850 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDR2Q01850 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDR2Q01850 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDR2Q01850 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDR2Q01850 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDR2Q01850 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CDR2Q01850 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDR2Q01850 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDR2Q01850 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDR2Q01850 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDR2Q01850 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDR2Q01850 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDR2Q01850 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDR2Q01850 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDR2Q01850 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDR2Q01850 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDR2Q01850 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDR2Q01850 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDR2Q01850 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDR2Q01850 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDR2Q01850 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDR2Q01850 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDR2Q01850 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDR2Q01850 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDR2Q01850 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDR2Q01850 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CDR2Q01850 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDR2Q01850 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms