Protein–RNA interactions for Protein: Q01831

XPC, DNA repair protein complementing XP-C cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPCQ01831 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC31.31■■■□□ 2.6
XPCQ01831 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC31.31■■■□□ 2.6
XPCQ01831 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
XPCQ01831 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC31.3■■■□□ 2.6
XPCQ01831 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC31.3■■■□□ 2.6
XPCQ01831 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC31.3■■■□□ 2.6
XPCQ01831 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
XPCQ01831 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
XPCQ01831 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
XPCQ01831 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
XPCQ01831 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC31.29■■■□□ 2.6
XPCQ01831 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
XPCQ01831 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
XPCQ01831 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
XPCQ01831 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
XPCQ01831 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
XPCQ01831 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
XPCQ01831 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
XPCQ01831 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
XPCQ01831 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC31.28■■■□□ 2.6
XPCQ01831 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
XPCQ01831 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
XPCQ01831 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
XPCQ01831 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
XPCQ01831 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
XPCQ01831 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
XPCQ01831 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
XPCQ01831 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
XPCQ01831 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
XPCQ01831 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
XPCQ01831 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
XPCQ01831 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
XPCQ01831 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.6
XPCQ01831 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC31.26■■■□□ 2.6
XPCQ01831 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
XPCQ01831 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
XPCQ01831 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
XPCQ01831 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC31.26■■■□□ 2.59
XPCQ01831 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC31.26■■■□□ 2.59
XPCQ01831 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC31.26■■■□□ 2.59
XPCQ01831 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
XPCQ01831 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
XPCQ01831 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
XPCQ01831 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC31.25■■■□□ 2.59
XPCQ01831 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC31.25■■■□□ 2.59
XPCQ01831 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
XPCQ01831 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC31.25■■■□□ 2.59
XPCQ01831 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC31.24■■■□□ 2.59
XPCQ01831 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
XPCQ01831 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
XPCQ01831 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
XPCQ01831 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
XPCQ01831 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
XPCQ01831 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
XPCQ01831 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
XPCQ01831 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC31.23■■■□□ 2.59
XPCQ01831 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC31.23■■■□□ 2.59
XPCQ01831 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
XPCQ01831 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC31.23■■■□□ 2.59
XPCQ01831 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
XPCQ01831 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC31.22■■■□□ 2.59
XPCQ01831 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC31.22■■■□□ 2.59
XPCQ01831 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
XPCQ01831 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
XPCQ01831 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
XPCQ01831 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
XPCQ01831 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
XPCQ01831 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
XPCQ01831 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
XPCQ01831 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
XPCQ01831 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
XPCQ01831 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
XPCQ01831 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.59
XPCQ01831 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
XPCQ01831 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
XPCQ01831 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC31.2■■■□□ 2.59
XPCQ01831 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
XPCQ01831 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.59
XPCQ01831 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
XPCQ01831 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
XPCQ01831 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
XPCQ01831 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
XPCQ01831 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
XPCQ01831 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
XPCQ01831 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
XPCQ01831 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC31.19■■■□□ 2.58
XPCQ01831 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC31.19■■■□□ 2.58
XPCQ01831 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
XPCQ01831 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
XPCQ01831 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
XPCQ01831 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
XPCQ01831 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC31.18■■■□□ 2.58
XPCQ01831 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
XPCQ01831 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
XPCQ01831 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
XPCQ01831 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
XPCQ01831 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
XPCQ01831 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
XPCQ01831 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
XPCQ01831 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC31.17■■■□□ 2.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms