Protein–RNA interactions for Protein: P84077

ARF1, ADP-ribosylation factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF1P84077 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
ARF1P84077 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ARF1P84077 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ARF1P84077 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ARF1P84077 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ARF1P84077 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ARF1P84077 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ARF1P84077 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ARF1P84077 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ARF1P84077 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ARF1P84077 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ARF1P84077 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ARF1P84077 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ARF1P84077 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ARF1P84077 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ARF1P84077 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ARF1P84077 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ARF1P84077 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ARF1P84077 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ARF1P84077 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ARF1P84077 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
ARF1P84077 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ARF1P84077 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ARF1P84077 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ARF1P84077 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ARF1P84077 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
ARF1P84077 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
ARF1P84077 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
ARF1P84077 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
ARF1P84077 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ARF1P84077 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ARF1P84077 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ARF1P84077 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ARF1P84077 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ARF1P84077 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ARF1P84077 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ARF1P84077 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ARF1P84077 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ARF1P84077 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ARF1P84077 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ARF1P84077 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ARF1P84077 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ARF1P84077 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ARF1P84077 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ARF1P84077 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ARF1P84077 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ARF1P84077 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ARF1P84077 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ARF1P84077 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ARF1P84077 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ARF1P84077 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ARF1P84077 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ARF1P84077 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ARF1P84077 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ARF1P84077 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ARF1P84077 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ARF1P84077 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ARF1P84077 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ARF1P84077 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ARF1P84077 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ARF1P84077 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ARF1P84077 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ARF1P84077 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ARF1P84077 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ARF1P84077 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ARF1P84077 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ARF1P84077 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ARF1P84077 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ARF1P84077 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ARF1P84077 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ARF1P84077 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ARF1P84077 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ARF1P84077 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ARF1P84077 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ARF1P84077 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ARF1P84077 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ARF1P84077 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ARF1P84077 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ARF1P84077 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ARF1P84077 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ARF1P84077 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ARF1P84077 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ARF1P84077 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ARF1P84077 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ARF1P84077 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ARF1P84077 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ARF1P84077 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ARF1P84077 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ARF1P84077 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ARF1P84077 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ARF1P84077 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ARF1P84077 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ARF1P84077 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ARF1P84077 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ARF1P84077 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ARF1P84077 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ARF1P84077 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ARF1P84077 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ARF1P84077 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ARF1P84077 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms