Protein–RNA interactions for Protein: P78333

GPC5, Glypican-5, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC5P78333 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GPC5P78333 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GPC5P78333 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GPC5P78333 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GPC5P78333 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
GPC5P78333 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GPC5P78333 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GPC5P78333 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GPC5P78333 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GPC5P78333 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GPC5P78333 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
GPC5P78333 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GPC5P78333 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GPC5P78333 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GPC5P78333 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GPC5P78333 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GPC5P78333 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GPC5P78333 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GPC5P78333 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GPC5P78333 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GPC5P78333 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GPC5P78333 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GPC5P78333 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GPC5P78333 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GPC5P78333 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GPC5P78333 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GPC5P78333 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GPC5P78333 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GPC5P78333 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GPC5P78333 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GPC5P78333 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GPC5P78333 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
GPC5P78333 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
GPC5P78333 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GPC5P78333 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GPC5P78333 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GPC5P78333 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GPC5P78333 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GPC5P78333 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GPC5P78333 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GPC5P78333 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GPC5P78333 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GPC5P78333 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GPC5P78333 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GPC5P78333 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GPC5P78333 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GPC5P78333 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GPC5P78333 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GPC5P78333 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GPC5P78333 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
GPC5P78333 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GPC5P78333 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
GPC5P78333 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GPC5P78333 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GPC5P78333 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GPC5P78333 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GPC5P78333 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GPC5P78333 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GPC5P78333 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GPC5P78333 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GPC5P78333 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GPC5P78333 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GPC5P78333 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GPC5P78333 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GPC5P78333 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GPC5P78333 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GPC5P78333 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GPC5P78333 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GPC5P78333 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GPC5P78333 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GPC5P78333 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
GPC5P78333 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GPC5P78333 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GPC5P78333 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GPC5P78333 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GPC5P78333 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GPC5P78333 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GPC5P78333 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GPC5P78333 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GPC5P78333 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GPC5P78333 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GPC5P78333 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GPC5P78333 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GPC5P78333 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GPC5P78333 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GPC5P78333 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GPC5P78333 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GPC5P78333 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GPC5P78333 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GPC5P78333 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GPC5P78333 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GPC5P78333 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GPC5P78333 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GPC5P78333 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GPC5P78333 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
GPC5P78333 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GPC5P78333 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GPC5P78333 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GPC5P78333 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GPC5P78333 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms