Protein–RNA interactions for Protein: P61568

ERVK11-1, Putative endogenous retrovirus group K member 11-1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK11-1P61568 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVK11-1P61568 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVK11-1P61568 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVK11-1P61568 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVK11-1P61568 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVK11-1P61568 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVK11-1P61568 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVK11-1P61568 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVK11-1P61568 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVK11-1P61568 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVK11-1P61568 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVK11-1P61568 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVK11-1P61568 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVK11-1P61568 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVK11-1P61568 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVK11-1P61568 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVK11-1P61568 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVK11-1P61568 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVK11-1P61568 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVK11-1P61568 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVK11-1P61568 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVK11-1P61568 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVK11-1P61568 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVK11-1P61568 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVK11-1P61568 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVK11-1P61568 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVK11-1P61568 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVK11-1P61568 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVK11-1P61568 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVK11-1P61568 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVK11-1P61568 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVK11-1P61568 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVK11-1P61568 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVK11-1P61568 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVK11-1P61568 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVK11-1P61568 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVK11-1P61568 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVK11-1P61568 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVK11-1P61568 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVK11-1P61568 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVK11-1P61568 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVK11-1P61568 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVK11-1P61568 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVK11-1P61568 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVK11-1P61568 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVK11-1P61568 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVK11-1P61568 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVK11-1P61568 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVK11-1P61568 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVK11-1P61568 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVK11-1P61568 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVK11-1P61568 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVK11-1P61568 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVK11-1P61568 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVK11-1P61568 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVK11-1P61568 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVK11-1P61568 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVK11-1P61568 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ERVK11-1P61568 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ERVK11-1P61568 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ERVK11-1P61568 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ERVK11-1P61568 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ERVK11-1P61568 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ERVK11-1P61568 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ERVK11-1P61568 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ERVK11-1P61568 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ERVK11-1P61568 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ERVK11-1P61568 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ERVK11-1P61568 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ERVK11-1P61568 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ERVK11-1P61568 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ERVK11-1P61568 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ERVK11-1P61568 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ERVK11-1P61568 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ERVK11-1P61568 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ERVK11-1P61568 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ERVK11-1P61568 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVK11-1P61568 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVK11-1P61568 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVK11-1P61568 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVK11-1P61568 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVK11-1P61568 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVK11-1P61568 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVK11-1P61568 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVK11-1P61568 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVK11-1P61568 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVK11-1P61568 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVK11-1P61568 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVK11-1P61568 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ERVK11-1P61568 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ERVK11-1P61568 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ERVK11-1P61568 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ERVK11-1P61568 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ERVK11-1P61568 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ERVK11-1P61568 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ERVK11-1P61568 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ERVK11-1P61568 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
ERVK11-1P61568 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
ERVK11-1P61568 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ERVK11-1P61568 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.9 ms