Protein–RNA interactions for Protein: P57678

GEMIN4, Gem-associated protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,058 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEMIN4P57678 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GEMIN4P57678 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
GEMIN4P57678 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
GEMIN4P57678 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GEMIN4P57678 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GEMIN4P57678 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GEMIN4P57678 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GEMIN4P57678 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GEMIN4P57678 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GEMIN4P57678 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
GEMIN4P57678 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GEMIN4P57678 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GEMIN4P57678 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GEMIN4P57678 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
GEMIN4P57678 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GEMIN4P57678 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GEMIN4P57678 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GEMIN4P57678 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GEMIN4P57678 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GEMIN4P57678 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GEMIN4P57678 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GEMIN4P57678 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GEMIN4P57678 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GEMIN4P57678 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GEMIN4P57678 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GEMIN4P57678 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GEMIN4P57678 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GEMIN4P57678 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GEMIN4P57678 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GEMIN4P57678 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GEMIN4P57678 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
GEMIN4P57678 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GEMIN4P57678 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GEMIN4P57678 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GEMIN4P57678 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GEMIN4P57678 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GEMIN4P57678 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
GEMIN4P57678 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GEMIN4P57678 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GEMIN4P57678 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GEMIN4P57678 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GEMIN4P57678 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GEMIN4P57678 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GEMIN4P57678 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GEMIN4P57678 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GEMIN4P57678 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GEMIN4P57678 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GEMIN4P57678 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
GEMIN4P57678 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GEMIN4P57678 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
GEMIN4P57678 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GEMIN4P57678 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GEMIN4P57678 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GEMIN4P57678 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GEMIN4P57678 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GEMIN4P57678 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GEMIN4P57678 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GEMIN4P57678 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GEMIN4P57678 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GEMIN4P57678 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GEMIN4P57678 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GEMIN4P57678 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GEMIN4P57678 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GEMIN4P57678 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GEMIN4P57678 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GEMIN4P57678 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GEMIN4P57678 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GEMIN4P57678 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GEMIN4P57678 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
GEMIN4P57678 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GEMIN4P57678 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GEMIN4P57678 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GEMIN4P57678 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GEMIN4P57678 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GEMIN4P57678 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GEMIN4P57678 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GEMIN4P57678 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GEMIN4P57678 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GEMIN4P57678 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GEMIN4P57678 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GEMIN4P57678 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GEMIN4P57678 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GEMIN4P57678 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
GEMIN4P57678 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
GEMIN4P57678 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
GEMIN4P57678 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
GEMIN4P57678 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GEMIN4P57678 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GEMIN4P57678 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GEMIN4P57678 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GEMIN4P57678 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GEMIN4P57678 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GEMIN4P57678 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
GEMIN4P57678 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GEMIN4P57678 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GEMIN4P57678 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GEMIN4P57678 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GEMIN4P57678 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GEMIN4P57678 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GEMIN4P57678 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms