Protein–RNA interactions for Protein: P56182

RRP1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP1P56182 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
RRP1P56182 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RRP1P56182 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
RRP1P56182 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
RRP1P56182 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
RRP1P56182 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RRP1P56182 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
RRP1P56182 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
RRP1P56182 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
RRP1P56182 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
RRP1P56182 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
RRP1P56182 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
RRP1P56182 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
RRP1P56182 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
RRP1P56182 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
RRP1P56182 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RRP1P56182 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RRP1P56182 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
RRP1P56182 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RRP1P56182 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RRP1P56182 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
RRP1P56182 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RRP1P56182 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RRP1P56182 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RRP1P56182 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
RRP1P56182 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.28
RRP1P56182 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
RRP1P56182 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
RRP1P56182 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
RRP1P56182 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.27
RRP1P56182 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
RRP1P56182 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
RRP1P56182 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
RRP1P56182 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
RRP1P56182 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
RRP1P56182 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
RRP1P56182 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
RRP1P56182 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
RRP1P56182 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
RRP1P56182 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
RRP1P56182 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RRP1P56182 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
RRP1P56182 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
RRP1P56182 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
RRP1P56182 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
RRP1P56182 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
RRP1P56182 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RRP1P56182 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
RRP1P56182 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
RRP1P56182 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
RRP1P56182 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
RRP1P56182 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RRP1P56182 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
RRP1P56182 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
RRP1P56182 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
RRP1P56182 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
RRP1P56182 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
RRP1P56182 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
RRP1P56182 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
RRP1P56182 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
RRP1P56182 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
RRP1P56182 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
RRP1P56182 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
RRP1P56182 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
RRP1P56182 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
RRP1P56182 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
RRP1P56182 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RRP1P56182 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
RRP1P56182 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
RRP1P56182 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RRP1P56182 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RRP1P56182 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RRP1P56182 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
RRP1P56182 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RRP1P56182 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
RRP1P56182 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
RRP1P56182 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
RRP1P56182 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
RRP1P56182 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
RRP1P56182 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
RRP1P56182 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
RRP1P56182 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
RRP1P56182 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
RRP1P56182 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
RRP1P56182 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
RRP1P56182 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
RRP1P56182 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
RRP1P56182 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
RRP1P56182 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RRP1P56182 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
RRP1P56182 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
RRP1P56182 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RRP1P56182 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
RRP1P56182 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
RRP1P56182 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RRP1P56182 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RRP1P56182 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
RRP1P56182 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
RRP1P56182 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
RRP1P56182 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms