Protein–RNA interactions for Protein: P54829

PTPN5, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 5, humanhuman

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN5P54829 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPN5P54829 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPN5P54829 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPN5P54829 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPN5P54829 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPN5P54829 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPN5P54829 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPN5P54829 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPN5P54829 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPN5P54829 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPN5P54829 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPN5P54829 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPN5P54829 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPN5P54829 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPN5P54829 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPN5P54829 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPN5P54829 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPN5P54829 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPN5P54829 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPN5P54829 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPN5P54829 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPN5P54829 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPN5P54829 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPN5P54829 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPN5P54829 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPN5P54829 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPN5P54829 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPN5P54829 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPN5P54829 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPN5P54829 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPN5P54829 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPN5P54829 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPN5P54829 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPN5P54829 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPN5P54829 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPN5P54829 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPN5P54829 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPN5P54829 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPN5P54829 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPN5P54829 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPN5P54829 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPN5P54829 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPN5P54829 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPN5P54829 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPN5P54829 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPN5P54829 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPN5P54829 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
PTPN5P54829 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PTPN5P54829 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PTPN5P54829 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPN5P54829 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPN5P54829 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPN5P54829 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPN5P54829 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPN5P54829 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPN5P54829 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPN5P54829 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPN5P54829 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPN5P54829 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPN5P54829 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPN5P54829 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPN5P54829 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPN5P54829 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPN5P54829 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPN5P54829 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPN5P54829 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPN5P54829 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPN5P54829 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPN5P54829 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPN5P54829 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPN5P54829 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPN5P54829 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPN5P54829 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPN5P54829 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPN5P54829 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPN5P54829 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPN5P54829 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPN5P54829 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPN5P54829 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPN5P54829 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPN5P54829 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPN5P54829 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPN5P54829 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPN5P54829 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPN5P54829 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPN5P54829 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPN5P54829 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPN5P54829 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPN5P54829 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPN5P54829 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPN5P54829 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPN5P54829 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPN5P54829 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPN5P54829 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPN5P54829 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPN5P54829 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPN5P54829 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPN5P54829 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPN5P54829 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPN5P54829 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms