Protein–RNA interactions for Protein: P53847

DSL1, Protein transport protein DSL1, yeast

Predictions only

Length 754 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DSL1	P53847	ECM32	YER176W	3366 nt		4.83	□□□□□ -1.64
DSL1	P53847	ARP10	YDR106W	855 nt		4.83	□□□□□ -1.64
DSL1	P53847	COQ4	YDR204W	1008 nt		4.83	□□□□□ -1.64
DSL1	P53847	YHR127W	YHR127W	732 nt		4.83	□□□□□ -1.64
DSL1	P53847	MAD2	YJL030W	591 nt		4.83	□□□□□ -1.64
DSL1	P53847	GTR1	YML121W	933 nt		4.83	□□□□□ -1.64
DSL1	P53847	RPL3	YOR063W	1164 nt		4.83	□□□□□ -1.64
DSL1	P53847	YOR289W	YOR289W	756 nt		4.83	□□□□□ -1.64
DSL1	P53847	YPR109W	YPR109W	885 nt		4.83	□□□□□ -1.64
DSL1	P53847	BBC1	YJL020C	3474 nt		4.83	□□□□□ -1.64
DSL1	P53847	HXT7	YDR342C	1713 nt		4.83	□□□□□ -1.64
DSL1	P53847	HXT6	YDR343C	1713 nt		4.83	□□□□□ -1.64
DSL1	P53847	YAP1	YML007W	1953 nt		4.82	□□□□□ -1.64
DSL1	P53847	ISR1	YPR106W	1332 nt		4.82	□□□□□ -1.64
DSL1	P53847	FAP1	YNL023C	2898 nt		4.82	□□□□□ -1.64
DSL1	P53847	YGR011W	YGR011W	327 nt		4.82	□□□□□ -1.64
DSL1	P53847	FUN19	YAL034C	1242 nt		4.82	□□□□□ -1.64
DSL1	P53847	SFT2	YBL102W	648 nt		4.82	□□□□□ -1.64
DSL1	P53847	HOM3	YER052C	1584 nt		4.82	□□□□□ -1.64
DSL1	P53847	MPS3	YJL019W	2049 nt		4.82	□□□□□ -1.64
DSL1	P53847	KAR2	YJL034W	2049 nt		4.82	□□□□□ -1.64
DSL1	P53847	HER2	YMR293C	1395 nt		4.81	□□□□□ -1.64
DSL1	P53847	HSP82	YPL240C	2130 nt		4.81	□□□□□ -1.64
DSL1	P53847	YJL068C	YJL068C	900 nt		4.81	□□□□□ -1.64
DSL1	P53847	ARR1	YPR199C	885 nt		4.81	□□□□□ -1.64
DSL1	P53847	YCL022C	YCL022C	516 nt		4.81	□□□□□ -1.64
DSL1	P53847	NDC1	YML031W	1968 nt		4.81	□□□□□ -1.64
DSL1	P53847	GCN20	YFR009W	2259 nt		4.81	□□□□□ -1.64
DSL1	P53847	BUD22	YMR014W	1560 nt		4.81	□□□□□ -1.64
DSL1	P53847	DHH1	YDL160C	1521 nt		4.81	□□□□□ -1.64
DSL1	P53847	STE12	YHR084W	2067 nt		4.81	□□□□□ -1.64
DSL1	P53847	CAB3	YKL088W	1716 nt		4.8	□□□□□ -1.64
DSL1	P53847	MST1	YKL194C	1389 nt		4.8	□□□□□ -1.64
DSL1	P53847	IML2	YJL082W	2196 nt		4.8	□□□□□ -1.64
DSL1	P53847	BCP1	YDR361C	852 nt		4.8	□□□□□ -1.64
DSL1	P53847	YLL017W	YLL017W	312 nt		4.8	□□□□□ -1.64
DSL1	P53847	SSP120	YLR250W	705 nt		4.8	□□□□□ -1.64
DSL1	P53847	YBR056C-B	YBR056C-B	159 nt		4.8	□□□□□ -1.64
DSL1	P53847	FDC1	YDR539W	1512 nt		4.8	□□□□□ -1.64
DSL1	P53847	PHO84	YML123C	1764 nt		4.8	□□□□□ -1.64
DSL1	P53847	VID22	YLR373C	2706 nt		4.8	□□□□□ -1.64
DSL1	P53847	ASA1	YPR085C	1332 nt		4.79	□□□□□ -1.64
DSL1	P53847	INO2	YDR123C	915 nt		4.79	□□□□□ -1.64
DSL1	P53847	YDR417C	YDR417C	372 nt		4.79	□□□□□ -1.64
DSL1	P53847	ARC1	YGL105W	1131 nt		4.79	□□□□□ -1.64
DSL1	P53847	YJL215C	YJL215C	360 nt		4.79	□□□□□ -1.64
DSL1	P53847	POM33	YLL023C	840 nt		4.79	□□□□□ -1.64
DSL1	P53847	YLR125W	YLR125W	411 nt		4.79	□□□□□ -1.64
DSL1	P53847	YGP1	YNL160W	1065 nt		4.79	□□□□□ -1.64
DSL1	P53847	ZPS1	YOL154W	750 nt		4.79	□□□□□ -1.64
DSL1	P53847	MPC54	YOR177C	1395 nt		4.78	□□□□□ -1.64
DSL1	P53847	APJ1	YNL077W	1587 nt		4.78	□□□□□ -1.64
DSL1	P53847	YER134C	YER134C	537 nt		4.78	□□□□□ -1.64
DSL1	P53847	PSR1	YLL010C	1284 nt		4.78	□□□□□ -1.64
DSL1	P53847	MAP2	YBL091C	1266 nt		4.78	□□□□□ -1.64
DSL1	P53847	TLG2	YOL018C	1194 nt		4.78	□□□□□ -1.64
DSL1	P53847	ARG8	YOL140W	1272 nt		4.78	□□□□□ -1.64
DSL1	P53847	GSY1	YFR015C	2127 nt		4.78	□□□□□ -1.64
DSL1	P53847	BOP2	YLR267W	1713 nt		4.77	□□□□□ -1.65
DSL1	P53847	YBR139W	YBR139W	1527 nt		4.77	□□□□□ -1.65
DSL1	P53847	DXO1	YDR370C	1329 nt		4.77	□□□□□ -1.65
DSL1	P53847	THI5	YFL058W	1023 nt		4.77	□□□□□ -1.65
DSL1	P53847	YGL262W	YGL262W	528 nt		4.77	□□□□□ -1.65
DSL1	P53847	RPB4	YJL140W	666 nt		4.77	□□□□□ -1.65
DSL1	P53847	YMR086C-A	YMR086C-A	339 nt		4.77	□□□□□ -1.65
DSL1	P53847	THI12	YNL332W	1023 nt		4.77	□□□□□ -1.65
DSL1	P53847	MDM12	YOL009C	816 nt		4.77	□□□□□ -1.65
DSL1	P53847	UBA3	YPR066W	900 nt		4.77	□□□□□ -1.65
DSL1	P53847	TEA1	YOR337W	2280 nt		4.77	□□□□□ -1.65
DSL1	P53847	PRM7	YDL039C	2097 nt		4.77	□□□□□ -1.65
DSL1	P53847	RSM23	YGL129C	1353 nt		4.77	□□□□□ -1.65
DSL1	P53847	GSH2	YOL049W	1476 nt		4.76	□□□□□ -1.65
DSL1	P53847	CDC48	YDL126C	2508 nt		4.76	□□□□□ -1.65
DSL1	P53847	DCV1	YFR012W	609 nt		4.76	□□□□□ -1.65
DSL1	P53847	SPC34	YKR037C	888 nt		4.76	□□□□□ -1.65
DSL1	P53847	VPS36	YLR417W	1701 nt		4.76	□□□□□ -1.65
DSL1	P53847	YMR085W	YMR085W	1299 nt		4.76	□□□□□ -1.65
DSL1	P53847	THS1	YIL078W	2205 nt		4.76	□□□□□ -1.65
DSL1	P53847	EGT2	YNL327W	3126 nt		4.75	□□□□□ -1.65
DSL1	P53847	SAS4	YDR181C	1446 nt		4.75	□□□□□ -1.65
DSL1	P53847	TIM54	YJL054W	1437 nt		4.75	□□□□□ -1.65
DSL1	P53847	BUR6	YER159C	429 nt		4.75	□□□□□ -1.65
DSL1	P53847	VTA1	YLR181C	993 nt		4.75	□□□□□ -1.65
DSL1	P53847	SPS18	YNL204C	903 nt		4.75	□□□□□ -1.65
DSL1	P53847	CTR1	YPR124W	1221 nt		4.75	□□□□□ -1.65
DSL1	P53847	IXR1	YKL032C	1794 nt		4.75	□□□□□ -1.65
DSL1	P53847	SMP1	YBR182C	1359 nt		4.75	□□□□□ -1.65
DSL1	P53847	SKG6	YHR149C	2205 nt		4.74	□□□□□ -1.65
DSL1	P53847	UTP6	YDR449C	1323 nt		4.74	□□□□□ -1.65
DSL1	P53847	IMD3	YLR432W	1572 nt		4.74	□□□□□ -1.65
DSL1	P53847	SET4	YJL105W	1683 nt		4.74	□□□□□ -1.65
DSL1	P53847	SLO1	YER180C-A	258 nt		4.74	□□□□□ -1.65
DSL1	P53847	SEH1	YGL100W	1050 nt		4.74	□□□□□ -1.65
DSL1	P53847	DAM1	YGR113W	1032 nt		4.74	□□□□□ -1.65
DSL1	P53847	YHL034W-A	YHL034W-A	462 nt		4.74	□□□□□ -1.65
DSL1	P53847	EGD2	YHR193C	525 nt		4.74	□□□□□ -1.65
DSL1	P53847	GPP1	YIL053W	753 nt		4.74	□□□□□ -1.65
DSL1	P53847	DBR1	YKL149C	1218 nt		4.74	□□□□□ -1.65
DSL1	P53847	YLR402W	YLR402W	192 nt		4.74	□□□□□ -1.65
DSL1	P53847	PPA2	YMR267W	933 nt		4.74	□□□□□ -1.65

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