Protein–RNA interactions for Protein: P43407

Sdc2, Syndecan-2, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc2P43407 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sdc2P43407 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sdc2P43407 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sdc2P43407 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sdc2P43407 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sdc2P43407 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sdc2P43407 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sdc2P43407 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sdc2P43407 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sdc2P43407 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Sdc2P43407 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sdc2P43407 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sdc2P43407 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sdc2P43407 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sdc2P43407 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sdc2P43407 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sdc2P43407 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sdc2P43407 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sdc2P43407 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sdc2P43407 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sdc2P43407 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sdc2P43407 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sdc2P43407 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sdc2P43407 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sdc2P43407 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sdc2P43407 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sdc2P43407 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sdc2P43407 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sdc2P43407 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sdc2P43407 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sdc2P43407 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sdc2P43407 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sdc2P43407 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sdc2P43407 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sdc2P43407 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sdc2P43407 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Sdc2P43407 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sdc2P43407 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sdc2P43407 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sdc2P43407 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sdc2P43407 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sdc2P43407 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sdc2P43407 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sdc2P43407 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sdc2P43407 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sdc2P43407 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sdc2P43407 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sdc2P43407 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sdc2P43407 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sdc2P43407 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sdc2P43407 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sdc2P43407 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sdc2P43407 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sdc2P43407 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sdc2P43407 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sdc2P43407 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sdc2P43407 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sdc2P43407 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sdc2P43407 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sdc2P43407 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Sdc2P43407 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sdc2P43407 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Sdc2P43407 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sdc2P43407 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Sdc2P43407 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sdc2P43407 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sdc2P43407 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Sdc2P43407 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sdc2P43407 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sdc2P43407 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sdc2P43407 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sdc2P43407 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sdc2P43407 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sdc2P43407 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sdc2P43407 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sdc2P43407 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sdc2P43407 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sdc2P43407 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sdc2P43407 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sdc2P43407 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sdc2P43407 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sdc2P43407 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sdc2P43407 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sdc2P43407 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sdc2P43407 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sdc2P43407 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sdc2P43407 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sdc2P43407 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sdc2P43407 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sdc2P43407 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sdc2P43407 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sdc2P43407 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Sdc2P43407 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Sdc2P43407 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Sdc2P43407 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sdc2P43407 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sdc2P43407 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sdc2P43407 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sdc2P43407 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sdc2P43407 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms