Protein–RNA interactions for Protein: P25364

HCM1, Forkhead transcription factor HCM1, yeastyeast

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HCM1P25364 RNH202YDR279W 1053 nt5.49□□□□□ -1.53
HCM1P25364 BMH1YER177W 804 nt5.49□□□□□ -1.53
HCM1P25364 YHB1YGR234W 1200 nt5.49□□□□□ -1.53
HCM1P25364 APS3YJL024C 585 nt5.49□□□□□ -1.53
HCM1P25364 MIM2YLR099W-A 264 nt5.49□□□□□ -1.53
HCM1P25364 DOM34YNL001W 1161 nt5.49□□□□□ -1.53
HCM1P25364 NOP13YNL175C 1212 nt5.49□□□□□ -1.53
HCM1P25364 VMA4YOR332W 702 nt5.49□□□□□ -1.53
HCM1P25364 HSP104YLL026W 2727 nt5.49□□□□□ -1.53
HCM1P25364 FAT3YKL187C 2253 nt5.49□□□□□ -1.53
HCM1P25364 YRF1-4YLR466W 4149 nt5.49□□□□□ -1.53
HCM1P25364 EMW1YNL313C 2715 nt5.48□□□□□ -1.53
HCM1P25364 MSS1YMR023C 1581 nt5.48□□□□□ -1.53
HCM1P25364 ATF1YOR377W 1578 nt5.48□□□□□ -1.53
HCM1P25364 SPS22YCL048W 1392 nt5.48□□□□□ -1.53
HCM1P25364 YDL124WYDL124W 939 nt5.48□□□□□ -1.53
HCM1P25364 YDR282CYDR282C 1245 nt5.48□□□□□ -1.53
HCM1P25364 IRC22YEL001C 678 nt5.48□□□□□ -1.53
HCM1P25364 FZF1YGL254W 900 nt5.48□□□□□ -1.53
HCM1P25364 YGR204C-AYGR204C-A 114 nt5.48□□□□□ -1.53
HCM1P25364 YKL123WYKL123W 381 nt5.48□□□□□ -1.53
HCM1P25364 RCN1YKL159C 636 nt5.48□□□□□ -1.53
HCM1P25364 HMX1YLR205C 954 nt5.48□□□□□ -1.53
HCM1P25364 YOL106WYOL106W 354 nt5.48□□□□□ -1.53
HCM1P25364 YOL163WYOL163W 510 nt5.48□□□□□ -1.53
HCM1P25364 YPL162CYPL162C 822 nt5.48□□□□□ -1.53
HCM1P25364 CBC2YPL178W 627 nt5.48□□□□□ -1.53
HCM1P25364 TKL1YPR074C 2043 nt5.48□□□□□ -1.53
HCM1P25364 YHL012WYHL012W 1482 nt5.47□□□□□ -1.53
HCM1P25364 MLF3YNL074C 1359 nt5.47□□□□□ -1.53
HCM1P25364 NHP10YDL002C 612 nt5.47□□□□□ -1.53
HCM1P25364 MNN10YDR245W 1182 nt5.47□□□□□ -1.53
HCM1P25364 RPT3YDR394W 1287 nt5.47□□□□□ -1.53
HCM1P25364 BTN2YGR142W 1233 nt5.47□□□□□ -1.53
HCM1P25364 CPR7YJR032W 1182 nt5.47□□□□□ -1.53
HCM1P25364 COS9YKL219W 1224 nt5.47□□□□□ -1.53
HCM1P25364 YPT6YLR262C 648 nt5.47□□□□□ -1.53
HCM1P25364 RPL3YOR063W 1164 nt5.47□□□□□ -1.53
HCM1P25364 YOR152CYOR152C 771 nt5.47□□□□□ -1.53
HCM1P25364 FDH1YOR388C 1131 nt5.47□□□□□ -1.53
HCM1P25364 CSH1YBR161W 1131 nt5.47□□□□□ -1.53
HCM1P25364 HAP2YGL237C 798 nt5.46□□□□□ -1.54
HCM1P25364 YGR016WYGR016W 573 nt5.46□□□□□ -1.54
HCM1P25364 YMR187CYMR187C 1296 nt5.46□□□□□ -1.54
HCM1P25364 ALT1YLR089C 1779 nt5.46□□□□□ -1.54
HCM1P25364 EPS1YIL005W 2106 nt5.45□□□□□ -1.54
HCM1P25364 TNA1YGR260W 1605 nt5.45□□□□□ -1.54
HCM1P25364 FRS2YFL022C 1512 nt5.45□□□□□ -1.54
HCM1P25364 YIP5YGL161C 933 nt5.45□□□□□ -1.54
HCM1P25364 IRC9YJL142C 393 nt5.45□□□□□ -1.54
HCM1P25364 TEX1YNL253W 1269 nt5.45□□□□□ -1.54
HCM1P25364 GPM3YOL056W 912 nt5.45□□□□□ -1.54
HCM1P25364 SAS5YOR213C 747 nt5.45□□□□□ -1.54
HCM1P25364 YBR063CYBR063C 1215 nt5.45□□□□□ -1.54
HCM1P25364 DXO1YDR370C 1329 nt5.45□□□□□ -1.54
HCM1P25364 MCM3YEL032W 2916 nt5.44□□□□□ -1.54
HCM1P25364 GIT1YCR098C 1557 nt5.44□□□□□ -1.54
HCM1P25364 CPR1YDR155C 489 nt5.44□□□□□ -1.54
HCM1P25364 KEG1YFR042W 603 nt5.44□□□□□ -1.54
HCM1P25364 BGL2YGR282C 942 nt5.44□□□□□ -1.54
HCM1P25364 POM33YLL023C 840 nt5.44□□□□□ -1.54
HCM1P25364 SIC1YLR079W 855 nt5.44□□□□□ -1.54
HCM1P25364 YIM2YMR151W 438 nt5.44□□□□□ -1.54
HCM1P25364 EAF7YNL136W 1278 nt5.44□□□□□ -1.54
HCM1P25364 AIF1YNR074C 1137 nt5.44□□□□□ -1.54
HCM1P25364 PSH1YOL054W 1221 nt5.44□□□□□ -1.54
HCM1P25364 YOL150CYOL150C 312 nt5.44□□□□□ -1.54
HCM1P25364 MGE1YOR232W 687 nt5.44□□□□□ -1.54
HCM1P25364 CUP9YPL177C 921 nt5.44□□□□□ -1.54
HCM1P25364 TGL1YKL140W 1647 nt5.44□□□□□ -1.54
HCM1P25364 MKK2YPL140C 1521 nt5.43□□□□□ -1.54
HCM1P25364 SSK22YCR073C 3996 nt5.43□□□□□ -1.54
HCM1P25364 GUA1YMR217W 1578 nt5.43□□□□□ -1.54
HCM1P25364 YGL185CYGL185C 1140 nt5.43□□□□□ -1.54
HCM1P25364 tN(GUU)CtN(GUU)C 74 nt5.43□□□□□ -1.54
HCM1P25364 tN(GUU)FtN(GUU)F 74 nt5.43□□□□□ -1.54
HCM1P25364 YGL262WYGL262W 528 nt5.43□□□□□ -1.54
HCM1P25364 tN(GUU)GtN(GUU)G 74 nt5.43□□□□□ -1.54
HCM1P25364 tN(GUU)KtN(GUU)K 74 nt5.43□□□□□ -1.54
HCM1P25364 tN(GUU)LtN(GUU)L 74 nt5.43□□□□□ -1.54
HCM1P25364 tN(GUU)N1tN(GUU)N1 74 nt5.43□□□□□ -1.54
HCM1P25364 tN(GUU)N2tN(GUU)N2 74 nt5.43□□□□□ -1.54
HCM1P25364 tN(GUU)O1tN(GUU)O1 74 nt5.43□□□□□ -1.54
HCM1P25364 tN(GUU)O2tN(GUU)O2 74 nt5.43□□□□□ -1.54
HCM1P25364 tN(GUU)PtN(GUU)P 74 nt5.43□□□□□ -1.54
HCM1P25364 PSF2YJL072C 642 nt5.43□□□□□ -1.54
HCM1P25364 YJR012CYJR012C 624 nt5.43□□□□□ -1.54
HCM1P25364 CBF1YJR060W 1056 nt5.43□□□□□ -1.54
HCM1P25364 SMD2YLR275W 333 nt5.43□□□□□ -1.54
HCM1P25364 PDR16YNL231C 1056 nt5.43□□□□□ -1.54
HCM1P25364 TPT1YOL102C 693 nt5.43□□□□□ -1.54
HCM1P25364 SME1YOR159C 285 nt5.43□□□□□ -1.54
HCM1P25364 ETR1YBR026C 1143 nt5.43□□□□□ -1.54
HCM1P25364 YOR292CYOR292C 930 nt5.43□□□□□ -1.54
HCM1P25364 SNF8YPL002C 702 nt5.43□□□□□ -1.54
HCM1P25364 YBR053CYBR053C 1077 nt5.43□□□□□ -1.54
HCM1P25364 USV1YPL230W 1176 nt5.43□□□□□ -1.54
HCM1P25364 PWR1PWR1 941 nt5.43□□□□□ -1.54
HCM1P25364 RNR3YIL066C 2610 nt5.43□□□□□ -1.54
HCM1P25364 YIR007WYIR007W 2295 nt5.43□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 16.6 ms