Protein–RNA interactions for Protein: P0DMP2

SRGAP2B, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP2BP0DMP2 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SRGAP2BP0DMP2 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SRGAP2BP0DMP2 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SRGAP2BP0DMP2 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SRGAP2BP0DMP2 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SRGAP2BP0DMP2 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SRGAP2BP0DMP2 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SRGAP2BP0DMP2 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SRGAP2BP0DMP2 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SRGAP2BP0DMP2 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SRGAP2BP0DMP2 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SRGAP2BP0DMP2 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SRGAP2BP0DMP2 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SRGAP2BP0DMP2 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SRGAP2BP0DMP2 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SRGAP2BP0DMP2 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SRGAP2BP0DMP2 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SRGAP2BP0DMP2 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SRGAP2BP0DMP2 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SRGAP2BP0DMP2 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SRGAP2BP0DMP2 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SRGAP2BP0DMP2 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SRGAP2BP0DMP2 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SRGAP2BP0DMP2 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SRGAP2BP0DMP2 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SRGAP2BP0DMP2 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SRGAP2BP0DMP2 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SRGAP2BP0DMP2 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SRGAP2BP0DMP2 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SRGAP2BP0DMP2 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SRGAP2BP0DMP2 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SRGAP2BP0DMP2 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SRGAP2BP0DMP2 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SRGAP2BP0DMP2 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SRGAP2BP0DMP2 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SRGAP2BP0DMP2 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SRGAP2BP0DMP2 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SRGAP2BP0DMP2 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SRGAP2BP0DMP2 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SRGAP2BP0DMP2 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SRGAP2BP0DMP2 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SRGAP2BP0DMP2 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SRGAP2BP0DMP2 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SRGAP2BP0DMP2 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SRGAP2BP0DMP2 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SRGAP2BP0DMP2 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SRGAP2BP0DMP2 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SRGAP2BP0DMP2 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SRGAP2BP0DMP2 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SRGAP2BP0DMP2 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SRGAP2BP0DMP2 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SRGAP2BP0DMP2 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SRGAP2BP0DMP2 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SRGAP2BP0DMP2 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SRGAP2BP0DMP2 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SRGAP2BP0DMP2 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SRGAP2BP0DMP2 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SRGAP2BP0DMP2 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SRGAP2BP0DMP2 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SRGAP2BP0DMP2 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SRGAP2BP0DMP2 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SRGAP2BP0DMP2 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SRGAP2BP0DMP2 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SRGAP2BP0DMP2 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SRGAP2BP0DMP2 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SRGAP2BP0DMP2 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SRGAP2BP0DMP2 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SRGAP2BP0DMP2 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SRGAP2BP0DMP2 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SRGAP2BP0DMP2 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SRGAP2BP0DMP2 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SRGAP2BP0DMP2 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SRGAP2BP0DMP2 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SRGAP2BP0DMP2 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SRGAP2BP0DMP2 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SRGAP2BP0DMP2 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SRGAP2BP0DMP2 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SRGAP2BP0DMP2 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SRGAP2BP0DMP2 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SRGAP2BP0DMP2 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SRGAP2BP0DMP2 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SRGAP2BP0DMP2 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SRGAP2BP0DMP2 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SRGAP2BP0DMP2 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SRGAP2BP0DMP2 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SRGAP2BP0DMP2 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SRGAP2BP0DMP2 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SRGAP2BP0DMP2 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SRGAP2BP0DMP2 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SRGAP2BP0DMP2 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SRGAP2BP0DMP2 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SRGAP2BP0DMP2 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SRGAP2BP0DMP2 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SRGAP2BP0DMP2 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SRGAP2BP0DMP2 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SRGAP2BP0DMP2 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SRGAP2BP0DMP2 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SRGAP2BP0DMP2 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SRGAP2BP0DMP2 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SRGAP2BP0DMP2 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms