Protein–RNA interactions for Protein: P0DJI9

SAA2, Serum amyloid A-2 protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAA2P0DJI9 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SAA2P0DJI9 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SAA2P0DJI9 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SAA2P0DJI9 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SAA2P0DJI9 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SAA2P0DJI9 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SAA2P0DJI9 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SAA2P0DJI9 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SAA2P0DJI9 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SAA2P0DJI9 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SAA2P0DJI9 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SAA2P0DJI9 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SAA2P0DJI9 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SAA2P0DJI9 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SAA2P0DJI9 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SAA2P0DJI9 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SAA2P0DJI9 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SAA2P0DJI9 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SAA2P0DJI9 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SAA2P0DJI9 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SAA2P0DJI9 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SAA2P0DJI9 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SAA2P0DJI9 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SAA2P0DJI9 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SAA2P0DJI9 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SAA2P0DJI9 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SAA2P0DJI9 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SAA2P0DJI9 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SAA2P0DJI9 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SAA2P0DJI9 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SAA2P0DJI9 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SAA2P0DJI9 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SAA2P0DJI9 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SAA2P0DJI9 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SAA2P0DJI9 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SAA2P0DJI9 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SAA2P0DJI9 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SAA2P0DJI9 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SAA2P0DJI9 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SAA2P0DJI9 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SAA2P0DJI9 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SAA2P0DJI9 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SAA2P0DJI9 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SAA2P0DJI9 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SAA2P0DJI9 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SAA2P0DJI9 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SAA2P0DJI9 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SAA2P0DJI9 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SAA2P0DJI9 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SAA2P0DJI9 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SAA2P0DJI9 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SAA2P0DJI9 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SAA2P0DJI9 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SAA2P0DJI9 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SAA2P0DJI9 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SAA2P0DJI9 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SAA2P0DJI9 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SAA2P0DJI9 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SAA2P0DJI9 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SAA2P0DJI9 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SAA2P0DJI9 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SAA2P0DJI9 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SAA2P0DJI9 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SAA2P0DJI9 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SAA2P0DJI9 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SAA2P0DJI9 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SAA2P0DJI9 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
SAA2P0DJI9 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
SAA2P0DJI9 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SAA2P0DJI9 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SAA2P0DJI9 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SAA2P0DJI9 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SAA2P0DJI9 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SAA2P0DJI9 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SAA2P0DJI9 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SAA2P0DJI9 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SAA2P0DJI9 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SAA2P0DJI9 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SAA2P0DJI9 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SAA2P0DJI9 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SAA2P0DJI9 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SAA2P0DJI9 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SAA2P0DJI9 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SAA2P0DJI9 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SAA2P0DJI9 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SAA2P0DJI9 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SAA2P0DJI9 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SAA2P0DJI9 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SAA2P0DJI9 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SAA2P0DJI9 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SAA2P0DJI9 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SAA2P0DJI9 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SAA2P0DJI9 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SAA2P0DJI9 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SAA2P0DJI9 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SAA2P0DJI9 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SAA2P0DJI9 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SAA2P0DJI9 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SAA2P0DJI9 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SAA2P0DJI9 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms