Protein–RNA interactions for Protein: P0DI82

TRAPPC2B, Trafficking protein particle complex subunit 2B, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2BP0DI82 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRAPPC2BP0DI82 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRAPPC2BP0DI82 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRAPPC2BP0DI82 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
TRAPPC2BP0DI82 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRAPPC2BP0DI82 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRAPPC2BP0DI82 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRAPPC2BP0DI82 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRAPPC2BP0DI82 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAPPC2BP0DI82 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAPPC2BP0DI82 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAPPC2BP0DI82 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAPPC2BP0DI82 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAPPC2BP0DI82 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAPPC2BP0DI82 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAPPC2BP0DI82 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAPPC2BP0DI82 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAPPC2BP0DI82 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAPPC2BP0DI82 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAPPC2BP0DI82 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAPPC2BP0DI82 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAPPC2BP0DI82 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAPPC2BP0DI82 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAPPC2BP0DI82 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAPPC2BP0DI82 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAPPC2BP0DI82 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAPPC2BP0DI82 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRAPPC2BP0DI82 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRAPPC2BP0DI82 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRAPPC2BP0DI82 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRAPPC2BP0DI82 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRAPPC2BP0DI82 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRAPPC2BP0DI82 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRAPPC2BP0DI82 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRAPPC2BP0DI82 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRAPPC2BP0DI82 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRAPPC2BP0DI82 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRAPPC2BP0DI82 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRAPPC2BP0DI82 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRAPPC2BP0DI82 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRAPPC2BP0DI82 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRAPPC2BP0DI82 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRAPPC2BP0DI82 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRAPPC2BP0DI82 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRAPPC2BP0DI82 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRAPPC2BP0DI82 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRAPPC2BP0DI82 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRAPPC2BP0DI82 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRAPPC2BP0DI82 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRAPPC2BP0DI82 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRAPPC2BP0DI82 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRAPPC2BP0DI82 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRAPPC2BP0DI82 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRAPPC2BP0DI82 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRAPPC2BP0DI82 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRAPPC2BP0DI82 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRAPPC2BP0DI82 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRAPPC2BP0DI82 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRAPPC2BP0DI82 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRAPPC2BP0DI82 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRAPPC2BP0DI82 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRAPPC2BP0DI82 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRAPPC2BP0DI82 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRAPPC2BP0DI82 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRAPPC2BP0DI82 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRAPPC2BP0DI82 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRAPPC2BP0DI82 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRAPPC2BP0DI82 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRAPPC2BP0DI82 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRAPPC2BP0DI82 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRAPPC2BP0DI82 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRAPPC2BP0DI82 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRAPPC2BP0DI82 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRAPPC2BP0DI82 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRAPPC2BP0DI82 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRAPPC2BP0DI82 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRAPPC2BP0DI82 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRAPPC2BP0DI82 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRAPPC2BP0DI82 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRAPPC2BP0DI82 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRAPPC2BP0DI82 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
TRAPPC2BP0DI82 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
TRAPPC2BP0DI82 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRAPPC2BP0DI82 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRAPPC2BP0DI82 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRAPPC2BP0DI82 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRAPPC2BP0DI82 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRAPPC2BP0DI82 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRAPPC2BP0DI82 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRAPPC2BP0DI82 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRAPPC2BP0DI82 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
TRAPPC2BP0DI82 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TRAPPC2BP0DI82 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TRAPPC2BP0DI82 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TRAPPC2BP0DI82 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TRAPPC2BP0DI82 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TRAPPC2BP0DI82 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TRAPPC2BP0DI82 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TRAPPC2BP0DI82 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TRAPPC2BP0DI82 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms