Protein–RNA interactions for Protein: P08729

KRT7, Keratin, type II cytoskeletal 7, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT7P08729 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KRT7P08729 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KRT7P08729 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
KRT7P08729 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
KRT7P08729 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
KRT7P08729 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
KRT7P08729 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KRT7P08729 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KRT7P08729 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KRT7P08729 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KRT7P08729 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KRT7P08729 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KRT7P08729 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT7P08729 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT7P08729 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT7P08729 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT7P08729 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT7P08729 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT7P08729 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT7P08729 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT7P08729 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT7P08729 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT7P08729 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT7P08729 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT7P08729 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT7P08729 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT7P08729 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT7P08729 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT7P08729 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT7P08729 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT7P08729 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT7P08729 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT7P08729 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT7P08729 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT7P08729 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT7P08729 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT7P08729 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT7P08729 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT7P08729 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT7P08729 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT7P08729 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT7P08729 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT7P08729 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT7P08729 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT7P08729 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT7P08729 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT7P08729 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT7P08729 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT7P08729 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT7P08729 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT7P08729 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT7P08729 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT7P08729 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT7P08729 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT7P08729 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT7P08729 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT7P08729 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT7P08729 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT7P08729 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KRT7P08729 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
KRT7P08729 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
KRT7P08729 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
KRT7P08729 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT7P08729 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT7P08729 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT7P08729 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT7P08729 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT7P08729 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT7P08729 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT7P08729 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT7P08729 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT7P08729 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT7P08729 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT7P08729 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT7P08729 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT7P08729 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT7P08729 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT7P08729 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT7P08729 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT7P08729 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT7P08729 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRT7P08729 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRT7P08729 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRT7P08729 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRT7P08729 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRT7P08729 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRT7P08729 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRT7P08729 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRT7P08729 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
KRT7P08729 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRT7P08729 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRT7P08729 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRT7P08729 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT7P08729 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT7P08729 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT7P08729 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT7P08729 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT7P08729 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT7P08729 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT7P08729 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms