Protein–RNA interactions for Protein: P08727

KRT19, Keratin, type I cytoskeletal 19, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT19P08727 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT19P08727 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT19P08727 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT19P08727 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT19P08727 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT19P08727 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT19P08727 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT19P08727 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT19P08727 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT19P08727 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT19P08727 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT19P08727 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT19P08727 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT19P08727 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT19P08727 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KRT19P08727 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KRT19P08727 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KRT19P08727 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KRT19P08727 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KRT19P08727 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KRT19P08727 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KRT19P08727 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT19P08727 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT19P08727 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT19P08727 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT19P08727 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT19P08727 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT19P08727 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT19P08727 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT19P08727 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
KRT19P08727 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
KRT19P08727 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
KRT19P08727 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
KRT19P08727 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
KRT19P08727 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KRT19P08727 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KRT19P08727 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KRT19P08727 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KRT19P08727 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KRT19P08727 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KRT19P08727 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KRT19P08727 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
KRT19P08727 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KRT19P08727 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT19P08727 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT19P08727 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT19P08727 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT19P08727 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT19P08727 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT19P08727 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT19P08727 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT19P08727 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT19P08727 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT19P08727 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT19P08727 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT19P08727 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT19P08727 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT19P08727 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT19P08727 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT19P08727 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT19P08727 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT19P08727 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT19P08727 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT19P08727 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT19P08727 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT19P08727 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT19P08727 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT19P08727 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT19P08727 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT19P08727 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT19P08727 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT19P08727 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT19P08727 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT19P08727 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT19P08727 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT19P08727 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT19P08727 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT19P08727 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT19P08727 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT19P08727 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT19P08727 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT19P08727 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT19P08727 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT19P08727 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT19P08727 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT19P08727 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT19P08727 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT19P08727 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT19P08727 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT19P08727 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT19P08727 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT19P08727 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT19P08727 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT19P08727 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT19P08727 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT19P08727 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT19P08727 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
KRT19P08727 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
KRT19P08727 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
KRT19P08727 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms