Protein–RNA interactions for Protein: O43861

ATP9B, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9BO43861 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP9BO43861 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP9BO43861 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP9BO43861 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP9BO43861 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP9BO43861 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP9BO43861 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ATP9BO43861 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ATP9BO43861 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP9BO43861 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP9BO43861 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP9BO43861 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP9BO43861 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP9BO43861 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP9BO43861 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP9BO43861 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP9BO43861 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP9BO43861 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP9BO43861 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP9BO43861 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP9BO43861 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP9BO43861 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP9BO43861 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP9BO43861 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP9BO43861 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP9BO43861 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP9BO43861 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP9BO43861 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP9BO43861 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP9BO43861 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP9BO43861 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP9BO43861 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP9BO43861 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP9BO43861 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP9BO43861 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP9BO43861 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP9BO43861 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP9BO43861 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP9BO43861 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP9BO43861 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP9BO43861 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP9BO43861 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP9BO43861 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP9BO43861 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP9BO43861 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP9BO43861 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP9BO43861 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP9BO43861 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP9BO43861 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP9BO43861 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP9BO43861 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP9BO43861 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP9BO43861 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP9BO43861 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP9BO43861 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP9BO43861 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP9BO43861 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP9BO43861 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP9BO43861 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP9BO43861 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP9BO43861 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP9BO43861 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP9BO43861 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP9BO43861 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP9BO43861 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP9BO43861 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP9BO43861 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP9BO43861 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP9BO43861 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP9BO43861 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP9BO43861 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP9BO43861 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP9BO43861 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ATP9BO43861 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ATP9BO43861 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ATP9BO43861 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP9BO43861 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP9BO43861 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP9BO43861 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP9BO43861 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP9BO43861 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP9BO43861 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP9BO43861 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP9BO43861 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP9BO43861 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP9BO43861 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP9BO43861 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP9BO43861 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP9BO43861 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP9BO43861 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP9BO43861 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP9BO43861 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP9BO43861 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP9BO43861 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP9BO43861 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP9BO43861 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP9BO43861 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP9BO43861 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP9BO43861 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP9BO43861 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms