Protein–RNA interactions for Protein: O43557

TNFSF14, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 14, humanhuman

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF14O43557 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNFSF14O43557 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNFSF14O43557 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNFSF14O43557 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNFSF14O43557 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNFSF14O43557 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNFSF14O43557 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNFSF14O43557 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNFSF14O43557 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNFSF14O43557 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNFSF14O43557 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNFSF14O43557 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNFSF14O43557 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNFSF14O43557 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNFSF14O43557 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNFSF14O43557 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNFSF14O43557 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNFSF14O43557 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNFSF14O43557 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNFSF14O43557 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNFSF14O43557 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNFSF14O43557 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNFSF14O43557 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNFSF14O43557 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNFSF14O43557 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNFSF14O43557 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNFSF14O43557 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNFSF14O43557 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNFSF14O43557 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNFSF14O43557 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNFSF14O43557 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNFSF14O43557 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TNFSF14O43557 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TNFSF14O43557 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TNFSF14O43557 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNFSF14O43557 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNFSF14O43557 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNFSF14O43557 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNFSF14O43557 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNFSF14O43557 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNFSF14O43557 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNFSF14O43557 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNFSF14O43557 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TNFSF14O43557 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNFSF14O43557 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNFSF14O43557 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TNFSF14O43557 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNFSF14O43557 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TNFSF14O43557 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TNFSF14O43557 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNFSF14O43557 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNFSF14O43557 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNFSF14O43557 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNFSF14O43557 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNFSF14O43557 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNFSF14O43557 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNFSF14O43557 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNFSF14O43557 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNFSF14O43557 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNFSF14O43557 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNFSF14O43557 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNFSF14O43557 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TNFSF14O43557 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNFSF14O43557 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNFSF14O43557 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNFSF14O43557 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNFSF14O43557 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.15
TNFSF14O43557 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TNFSF14O43557 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNFSF14O43557 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNFSF14O43557 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNFSF14O43557 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNFSF14O43557 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNFSF14O43557 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNFSF14O43557 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNFSF14O43557 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNFSF14O43557 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNFSF14O43557 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNFSF14O43557 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNFSF14O43557 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNFSF14O43557 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNFSF14O43557 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNFSF14O43557 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNFSF14O43557 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNFSF14O43557 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNFSF14O43557 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNFSF14O43557 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNFSF14O43557 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNFSF14O43557 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TNFSF14O43557 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TNFSF14O43557 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TNFSF14O43557 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNFSF14O43557 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNFSF14O43557 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNFSF14O43557 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNFSF14O43557 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNFSF14O43557 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNFSF14O43557 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNFSF14O43557 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNFSF14O43557 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms